Mehiläisen siitepöly on tunnettu luonnollinen lääke ja yleinen ainesosa monenlaisissa ravintolisissä. Suosiosta huolimatta jotkut terveydenhuollon ammattilaiset ovat ilmaisseet skeptisyyttä sen tehokkuudesta sekä huolestuneisuudesta mahdollisista mehiläisten siitepölyn sivuvaikutuksista. Vaikka jotkut näistä sivuvaikutuksista, kuten vatsakipu tai pahoinvointi, ovat suhteellisen lieviä ja helposti hoidettavia, toiset ovat vakavampia ja vaativat ensiapua ja jopa sairaalahoitoa. Mehiläisen siitepölyn yleisimmät sivuvaikutukset ovat allergisia reaktioita, joille on tunnusomaista nenän tukkoisuus, kasvojen turvotus ja hengitysvaikeudet. Monet asiantuntijat varoittavat mehiläisten siitepölyn käytöstä raskauden aikana, koska sitä pidetään kohdun stimulaattorina, joka voi aiheuttaa keskenmenon tai ennenaikaisen synnytyksen.
Yritykset, jotka myyvät lisäravinteita, jotka koostuvat pääasiassa tai osittain mehiläisten siitepölystä, väittävät usein, että mehiläisten siitepölyä voidaan käyttää energian tuottamiseen, vatsavaivojen hoitoon ja herkistämiseen käyttäjiltä yleisiä allergeeneja, kuten ambroosia vastaan. Mitään näistä väitteistä ei ole tieteellisesti todistettu, ja joissakin tapauksissa mehiläisten siitepölyn sivuvaikutukset ovat samat kuin oireet, joita käyttäjä yrittää hoitaa. Vaikka on vaikea todistaa tai kiistää väitteitä siitä, että siitepöly antaa henkilölle paremman energian tai hyvinvoinnin tunteen, terveydenhuollon ammattilaiset ovat kyseenalaistaneet voimakkaasti mehiläisten siitepölyn markkinoijien väitteet siitä, että mehiläisten siitepöly voi auttaa estämään allergiaoireita. Skeptikoiden mukaan tunnetun allergeenin ottaminen suun kautta toivossa herkistymisestä vastaaville allergeeneille ei ole erityisen tehokasta ja voi aiheuttaa enemmän haittaa kuin hyötyä.
Vaikka harvinaista, anafylaktista sokkia, akuuttia hepatiittia ja munuaisten vajaatoimintaa on raportoitu mehiläisten siitepölyä käyttävillä ihmisillä. Jos henkilö on jo tietoinen siitä, että hän kärsii siitepölyallergioista, varovaisuus mehiläisten siitepölyn käytössä on luultavasti hyvä idea, ja henkilön tulee tarkistaa asia lääkäriltä ennen kuin hän käyttää mitään mehiläinen siitepölyä sisältävää lääkettä. Koska mehiläisten siitepölyä käytetään niin yleisesti monissa terveydenhuollon tuotteissa, mukaan lukien ravitsemuspalkit, juomat ja voiteet, ihmiset, jotka ovat huolissaan mehiläisten siitepölyn sivuvaikutuksista, lukisivat ainesosien merkinnät huolellisesti. Mehiläisen siitepölyn allergisen reaktion oireita, kuten kurkun kutinaa, hengityksen vinkumista tai turvotusta, on seurattava tarkasti. Jos ne muuttuvat vakaviksi tai jos mehiläisen siitepölyn haittavaikutuksista kärsivällä henkilöllä on tiedossa allergioita, on hakeuduttava välittömästi lääkärin hoitoon.