Mikrorahoitusorganisaatioita on monenlaisia. Mikrorahoitusta voi saada pankkien, osuuskuntien ja valtiosta riippumattomien järjestöjen kaltaisten instituutioiden kautta. On myös järjestöjä, jotka on perustettu tiettyihin yhteisöihin ja joiden tavoitteena on tukea omaa taloudellista kehitystä. Näitä ovat yhdistykset, luotto -osuuskunnat, yhteisöpankit ja pyörivät säästö- ja luottoyhdistykset (ROSCA).
Jotkut voittoa tavoittelevat liikepankit tarjoavat omia mikrolainoja tai pieniä lyhytaikaisia lainoja pienituloisille henkilöille tai yrittäjille, joilla ei ole vakuuksia. Nämä lainat liittyvät yleensä korkeisiin korkoihin. Monet liikepankit eivät kuitenkaan tarjoa mikrolainaa korkeiden riskien vuoksi. On myös pankkeja, jotka tarjoavat mikrolainaa vain, kun laina on taattu kolmannen osapuolen toimesta.
Pienessä yhteisössä asuvat ihmiset muodostavat joskus oman yhteisöpankin. Yhteisön pankit tarjoavat toisinaan lainoja noin viiden hengen ryhmille, toisin kuin yhdelle henkilölle. Kunkin ryhmän jäsenen kelpoisuus tuleviin lainoihin riippuu sitten kaikkien muiden ryhmän jäsenten menestyksestä, mikä taktiikka voi edistää solidaarisuutta. Osuuskunnat ovat samanlaisia kuin yhteisöpankit, mutta ne eivät välttämättä ole yhteisön jäsenten omistuksessa ja hallinnassa.
Luotto -osuuskunnat veloittavat yleensä erittäin alhaisia korkoja ja antavat lainaa unionin jäsenille yhdistetyistä talletuksistaan. ROSCA-yhtiöissä, jotka ovat pienempiä ja yleensä korottomia vaihteluita luotto-osuuskunnissa, yksilöryhmät sijoittavat taloudelliset resurssinsa yhteen ryhmän jäseneen kerrallaan. Tämä antaa jokaiselle yksilölle mahdollisuuden sijoittaa kertasumman omaan projektiinsa. Jos siis 12 ihmistä sijoittaa kumpikin 5 dollaria Yhdysvaltain dollareita (USD) käytettävissä olevista tuloista kuukaudessa ROSCA -järjestelmään, heille voitaisiin antaa 60 dollarin pääomaa käyttää kuukausi vuodessa.
On myös kansalaisjärjestöjä, jotka voivat toimia mikrorahoitusjärjestöinä sen lisäksi, että ne tarjoavat niihin liittyviä palveluja köyhille yhteisöille, kuten liike -elämän ja taloudellisen koulutuksen. Jotkut valtiosta riippumattomat järjestöt ovat todellakin omistautuneet pelkästään miksaamisen helpottamiseen sekä maiden sisällä että niiden välillä. Useat valtiosta riippumattomat järjestöt tarjoavat myös mahdollisuuden mikronäyttelyyn verkossa.
Vaikka monet mikrorahoitusjärjestöt ovat auttaneet ihmisiä välttämään köyhyyttä, hyväksikäyttötapauksia ja luottamuksen väärinkäytöksiä voi ja on tapahtunut. Pyrkiessään auttamaan ihmisiä miksaussekoittamisessa on syytä tutkia huolellisesti useita mikrorahoitusorganisaatioita ja niiden menestystä yhteisöjen todellisessa auttamisessa ennen resurssien sijoittamista. On myös mahdollista toimia riippumattomasti muodollisista mikrorahoitusjärjestöistä. Asianmukaisten lakisääteisten ohjeiden avulla yksilöt voivat tutkia apua tarvitsevia ihmisiä tai yhteisöjä, muodostaa suoran yhteyden ja neuvotella omista ehdoistaan investoinneille tai lahjoituksille.