Ostamasi minipyörän runko riippuu täysin rakennettavan pyörän koosta, tarkoituksesta ja rakenteesta. Esimerkiksi motocross-minipyörän runko on eri muodoltaan ja painoltaan erilainen kuin mini-katu-tyylinen runko. Mini-moto on eri muodoltaan ja painoltaan kuin chopper-pyörälle tehty runko, ja kaikki nämä kehykset eroavat nelipyörän mini-pyörän rungosta. Minipyörän runkosuunnittelun periaatteet ovat melko samanlaisia kuin täysikokoisten polkupyörien valmistuksessa käytetyt runkosuunnittelun periaatteet; minipyörän kehykset on yksinkertaisesti tehty paljon pienemmässä mittakaavassa.
Motocross -minipyörän runko on suunniteltu kestämään urheiluun liittyviä jatkuvia ja raskaita iskuja. Hitsit ovat todennäköisesti melko jäykkiä, vaikka rakentajat valitsevat yleensä mieluummin myös kevyen kehyksen, mikä mahdollistaa hyppäämisen ja nopeat käännökset. Rungon muotoilu on yhdenmukainen täysikokoisten motocross -pyörien kanssa; päätuen kulma on todennäköisesti melko löysä, jotta se mahtuu pitkän matkan haarukkaan, ja runko tulee kahdesta osasta: pääkolmio ja takavipu. Takavipu mahdollistaa jousituksen asentamisen pyörän takaosaan, mutta takapyörän kiinnittämisen runkoon. Kääntövarsi on kiinnitetty pääkolmioon kääntöpisteessä, joka yleensä koostuu holkeista ja/tai laakereista.
Silppurin minipyörän runko tulee monessa tapauksessa yhtenä kappaleena, vaikka joitakin pehmeän hännän versioita saattaa olla saatavilla. Chopper -minipyörän rungossa on erittäin löysä päätykulma, joka sopii äärimmäisen rentoon ajoasentoon ja runkoon kiinnitettävään erittäin pitkään haarukkaan. Itse runko on todennäköisesti melko tukeva, varsinkin jos takajousitusta ei käytetä; runko joutuu vaimentamaan tien tärinää ja äkillisiä osumia.
Mini-moto-runko jäljittelee täysikokoisten katupyörien suunnittelua. Pääputken kulma ei ole yhtä jyrkkä kuin muuntyyppiset minipyöräkehykset, vaikka runko on lähes taatusti kaksiosainen: pääkolmio ja takavipu. Mini-motoon kiinnitetty haarukka ei pyyhkäise pois suuressa kulmassa, kuten motocross- tai chopper-pyörät; tämä auttaa ohjauksessa ja aerodynamiikassa. Runko on myös kevyt, jotta se soveltuu kilpa -ajoon.