Erilaisia papukaijalajeja on satoja, eivätkä kaikki ole läheisesti sukua toisilleen. Eri lajeilla on erilaiset tarpeet luonnossa, ja niitä löytyy monista erilaisista ympäristöistä Aasiassa, Afrikassa, Keski- ja Etelä -Amerikassa sekä Australiassa. Luonnossa papukaija-elinympäristöihin kuuluvat trooppiset ja subtrooppiset sademetsät, rannikkoalueiden kosteikkoalueet, metsät ja muut alueet, joilla on leuto ilmasto ja puita, joilla linnut voivat elää. Vankeudessa papukaija-elinympäristöt koostuvat yleensä keskikokoisesta häkistä, joka mahdollistaa lintu tarpeeksi tilaa lentää lyhyitä matkoja.
On olemassa erilaisia papukaija -elinympäristöjä ihmisille, jotka haluavat pitää nämä linnut lemmikkeinä. Useimmat elinympäristöt ovat häkkien muodossa, joiden koko vaihtelee muutamasta kuutiometristä 100 tai enemmän kuutiometriin (1 kuutiometri = 0.028 kuutiometriä). Ihmiset pitävät yleensä lemmikkieläimiä keskikokoisissa häkeissä, jotka ovat riittävän pitkiä lintujen lentämiseksi. Paraketteja voidaan pitää pienemmissä häkeissä ja ottaa usein ulos, jotta ne voivat lentää sisätiloissa. Suuria lintuja käytetään usein useiden lintujen sijoittamiseen, ja ne voivat olla riittävän suuria, jotta ihmiset voivat tulla papukaijan elinympäristöön vuorovaikutuksessa lemmikkinsä kanssa sen sijaan, että ne ottavat linnut pois häkistä.
Monet papukaijalajit elävät tropiikissa. Vaikka monet tropiikin alueet ovat lämpimiä ympäri vuoden, korkealla sijaitsevat vuoristoalueet voivat pysyä viileinä tai jopa kylminä ympäri vuoden. Papukaijan lajista riippuen nämä linnut saattavat suosia yhtä tai toista näistä elinympäristöistä. Trooppisten papukaijojen elinympäristöt ovat yleensä sateisia ympäri vuoden, mikä antaa näille linnuille runsaasti vettä ja trooppisia kasveja, jotka menestyvät märissä olosuhteissa. Paraketit voivat käyttää kasveja elinympäristöissään ruoaksi, suojaksi ja suojaksi saalistajilta.
Muita papukaijalajeja löytyy subtrooppisesta ilmastosta. Nämä linnut ovat yleensä kestävämpiä lämpötilan vaihteluita vastaan, koska subtrooppisilla alueilla on usein lämpimämpi kesä ja viileämpi talvi kuin jatkuvasti lämpimillä tai viileillä trooppisilla alueilla. Sateet voivat olla satunnaisempia myös subtrooppisilla alueilla. Papukaijan elinympäristöjä näissä osissa maailmaa voivat olla pensaikot, savannit, metsät, suot, sademetsät, viidakot tai jopa kuivat maisemat, kuten aavikot. Jokainen papukaijalaji soveltuu kuitenkin vain yhteen elinympäristöön, ja monet kuolevat, jos ne siirretään sellaiselle ilmastovyöhykkeelle, jota niiden laji ei ole kehittynyt miehittämään.