On kaksi eri tyyppistä ponttoniveneiden perävaunua, joita käytetään ponttoniveneiden kuljettamiseen veteen ja veteen. Vanhin ja yleisin tyyppi on ponttoniveneiden perävaunujen kapea, kannen tukeva tyyli. Tämä muotoilu asettaa ponttonin perävaunun rungon päälle, kun taas ponttoniterassi kulkee pehmustetuilla kiskoilla. Tämän tyyppisissä perävaunuissa on etuja ja haittoja, ja tämä malli on suosituin silloin, kun perävaunumatka on lyhyt. Pontoon-veneperävaunujen uusin ja vakain muotoilu on kehto, jonka avulla ponttonit voivat istua pienissä vaunuissa, jotka kulkevat perävaunun pituudelta ja tarjoavat erittäin vakaan alustan pitkän matkan perävaunuun.
Pontoon -veneet ovat erittäin suosittuja sekä järvillä että jokilla kalastukseen, viihdyttämiseen ja rauhallisten risteilyjen nauttimiseen. Useimmat ponttoniveneet jäävät veteen, kun ne pysyvät siellä veneilykauden loppuun asti, kun niitä säilytetään sesongin ulkopuolella. Silloin käytetään useimpia ponttoniveneiden perävaunuja. Tarvitaan myös ponttoniveneiden perävaunuja, kun veneen omistaja ei asu veden päällä. Tämä edellyttää, että vene on perävaunussa veteen ja vedestä jokaista veneilyretkeä varten.
Varhaisimmassa ponttoniveneiden valmistuksessa käytetyssä suunnittelussa käytettiin perävaunun kannen tukityyliä. Pontoniveneiden perävaunut olivat hyvin kapeita, ja niissä käytettiin kahta toisiinsa yhdistettyä palkkia, jotka ajoivat sisäisiin renkaisiin ja vanteisiin. Perävaunu asetettiin veteen veneluiskalla ja ponttoni ajettiin perävaunun päälle, jakoi kaksi palkkia ja piti ne keskellä veneen kannen alla. Kun perävaunu vedettiin vedestä, vene lepää kiskoilla ja oli siten kuljetettavissa. Tämän mallin ongelmana on, että perävaunu on hyvin kapea ja ponttonivene kaatuu joskus, kun neuvotellaan terävästä kulmasta.
Moderni muotoilu ponttoniveneiden perävaunuissa käyttää leveää perävaunua, joka kuljettaa ponttoniveneen jokaisen ponttonin alla terassin alla. Perävaunussa on kaksi telineen kaltaista kokoonpanoa, jotka mahtuvat ponttonien alle ja tarjoavat leveämmän ja vakaamman asennon matkustettaessa. Telat ovat tyypillisesti mattojen peittämiä, jotta ne eivät vahingoita alumiini- tai komposiitti ponttoneja, joita löytyy useimmista ponttoniveneistä. Matto muuttuu erittäin liukkaaksi liotettuna veteen ja mahdollistaa ponttonin liukumisen helposti paikalleen perävaunussa, kun se on vedetty taakse.