Puuveneiden korjaukset voivat kattaa monenlaisia aiheita tiivistämisestä ja maalaamisesta kiinnittimien kiristämiseen, homeen puhdistamiseen ja jopa puun vaihtoon. Kaikista tehdyistä puuveneiden korjauksista harvat ovat yhtä tärkeitä ja kriittisiä kuin peräpeilin korjaus. Peräpeili löystyy tai mätänee ajoittain, mikä vaatii korjausta tai vaihtoa. Aluksen nylkemisen tai kölin vaihtamisen lisäksi tämä voi olla yksi aloittelijan vaikeimmista puuveneiden korjauksista. Suurin osa puuveneiden korjauksista voidaan suorittaa minimitaidolla ja laitteilla.
Koska puu on orgaaninen materiaali, on tärkeää pitää sen pinta puhtaana eikä siinä saa olla sieniä, hometta ja muita epäpuhtauksia. Nämä orgaaniset epäpuhtaudet voivat syödä puisen astian pintaan, mikä tekee puusta hyödytöntä ja jopa vaarallista. Veneen pesu laadukkaalla puuveneiden puhdistusaineella tappaa suurimman osan kasvusta pinnalta. Kuivattuaan puiset venekorjaukset voidaan tehdä, kuten kiristää kaikki löysät kiinnikkeet ja ruuvit ja levittää vedenpitävä tiiviste veneen pintaan. On erittäin tärkeää, että tiiviste on sopivan tyyppinen makean tai suolaisen veden käyttöön, jotta puu voidaan suojata asianmukaisesti.
Laminoiduilla puuveneillä tai pienistä puukaistoista, kuten talon sivuraideista, valmistetuissa veneissä on joskus tarpeen vaihtaa laudan välinen tiiviste. Tämäntyyppisten puuveneiden korjaukset voivat kestää hyvin kauan. Alkuperäinen tiiviste on ensin poistettava ja levyt on valmisteltava vastaanottamaan uusi tiiviste. Tällä hetkellä pehmeää tai mätäntynyttä puuta havaitaan usein, mikä edellyttää edelleen ja intensiivisempää puuveneiden korjaamista. Usein köli tai veneen pituutta kulkeva pitkä keskilauta vaurioituu osuessaan kiviin tai yksinkertaisesti mädäntynyt ajan myötä ja se on vaihdettava.
Kiilien korjaukset ja peräpeilien korjaukset on usein parempi jättää ammattilaisen tehtäväksi. Erityisesti perämoottorikäyttöisellä puisella veneellä köli kestää kaiken voiman, jota käytetään veneen eteenpäin viemiseen. Jos näitä puuveneiden korjauksia ei tehdä kunnolla, aluksella olevien turvallisuus voi olla vaarassa. Kun vaihdat rikkoutuneita tai puuttuvia laitteita, kuten ruuveja ja pultteja puuveneessä, on tärkeää, että käytetään vain ruostumatonta terästä tai merilaatua. Tämä estää ruosteen ja puuveneiden korjausten ennenaikaisen epäonnistumisen.