Mitkä ovat erilaiset RNA -eristyssarjat?

Useimmat ribonukleiinihapon (RNA) eristyspakkaukset voivat eristää korkealaatuisen RNA: n monenlaisista kudoksista ja organismityypeistä, mukaan lukien kasvit, eläimet ja virukset. Mitokondrio- ja ribosomaalinen RNA – vastaavasti mRNA ja rRNA – voivat vaatia erikoistuneita RNA -eristyspakkauksia, jotka ovat spesifisiä pienille RNA -juosteille. Muita tekijöitä, jotka voivat vaihdella eri eristyspakkauksissa, ovat näytteiden määrä, joita jokainen sarja voi käsitellä, ja aika, joka kestää näytteen täydelliseen käsittelyyn.

Yleisimpiä RNA -eristyssarjoja voidaan käyttää monenlaisiin sovelluksiin riippumatta siitä, mistä RNA on peräisin. Nisäkkään solut ja kudokset ovat hallitsevimpia lähteitä, joita käytetään RNA: n eristämiseen ja puhdistamiseen. Kasvisoluja ja viruksia käytetään myös molekyylibiologisissa kokeissa, jotka edellyttävät RNA -eristyspakkauksen käyttöä.

Kun kudos- tai verinäyte on kerätty, se on valmisteltava RNA: n eristämiseksi kriittisen prosessin aikana, joka tunnetaan solujen hajoamisena, erottumisena tai hajoamisena. Jos solumateriaalia ei lopeteta kokonaan, RNA -eristämisprosessi tuottaa vähemmän RNA: ta. Parhaat RNA -eristämissarjat sisältävät materiaaleja ja tarvikkeita solujen hajoamiseen ennen eristämistä ja RNA -puhdistusta eristämisen jälkeen.

Erityistapauksissa, joissa koe vaatii mRNA: ta tai rRNA: ta, on saatavilla erikoistuneita RNA -eristyspakkauksia erityisen pienille RNA -juosteille. Tällaiseen pakkaukseen sisältyvät materiaalit ja tarvikkeet voivat olla erilaisia ​​määrän ja koon suhteen. Nämä RNA-eristyspakkaukset ovat harvinaisempia kuin monikäyttöiset RNA-sarjat, ja kustannusero voi olla huomattava.

Monet tavalliset RNA -eristyssarjat on suunniteltu käytettäväksi kaikenlaisten kudosten ja solujen kanssa, ja ne voivat suorittaa reaktion noin 20 minuutissa. Solujen täydelliseen hajoamiseen kuluva aika voi vaihdella sen mukaan, missä solussa solut kerättiin. Solujen hajoamisvaiheen lisäksi RNA: n eristämisprosessi ja sen jälkeinen puhdistus ovat suhteellisen standardeja menettelyn ja ajan suhteen.

Toinen ominaisuus, joka voi olla spesifinen tietyille sarjoille, on reaktion käsittelyyn tarvittava näytemäärä. Vaikka jotkut eristyspakkaukset voivat vaatia suhteellisen suuren näytemäärän, muut sarjat voivat toimia hyvin pienemmällä tilavuudella. Tästä erosta voi olla hyötyä, jos näytteen tilavuus on rajoittava tekijä.
Useilla RNA -eristyssarjojen valmistajilla on vertailukaavioita saatavilla Internetistä. Näiden kaavioiden avulla voidaan nähdä erot niiden tuottamien eri sarjojen välillä. Eroja voivat olla erikoistuneet sovellustyypit, kemikaalit ja tarvittavat näytemäärät.