Sikainfluenssatestaus sisältää erikoistuneen laboratoriotestin, jota yleisesti kutsutaan PCR- tai polymeraasiketjureaktiotestiksi. Tämä testi kestää yleensä useita päiviä – viikon ennen kuin tulokset määritetään. Useimmat lääkärit varaavat PCR -testin käytön raskaana oleville naisille, ihmisille, jotka ovat joutuneet sairaalaan influenssan vuoksi, tai ihmisille, joilla on heikentynyt immuunijärjestelmä ja joilla on suurempi riski vakavista influenssakomplikaatioista. PCR-testi on ainoa influenssatesti, jolla voidaan diagnosoida erityisesti sikainfluenssa, ja se tehdään vertaamalla influenssa-tartunnan saaneen henkilön DNA-näytteitä sikainfluenssaviruksen geneettiseen rakenteeseen. Suurin osa ihmisistä, joiden epäillään sairastavan sikainfluenssaa, ei saa tätä testiä, ja heidät voidaan diagnosoida joko oireidensa perusteella tai nopean influenssadiagnostiikkatestin avulla.
Nopea influenssadiagnostiikkatesti on influenssatesti, jota useimmat lääkärit käyttävät. Se ei voi aina tehdä eroa tiettyjen influenssakantojen välillä, eikä sitä käytetä sikainfluenssan testaamiseen, mutta se voi usein havaita positiivisesti influenssaviruksen läsnäolon noin 10–70 prosenttia ajasta. Testi suoritetaan yleensä käyttäen tamponia, joka työnnetään nenän sisään tai suuhun, jotta näyte saadaan nenän kautta tai kurkun takaa. Kun näyte on otettu, lääkärit voivat testata sen laboratoriossa ja saada tulokset takaisin yleensä 30 minuutin kuluessa. Jos tulokset ovat positiivisia, lääkärit määräävät yleensä viruslääkkeitä ja lähettävät potilaat kotiin ohjeiden mukaan levätä paljon ja juoda runsaasti nesteitä.
Vaikka pikainfluenssadiagnostiikkatesti ei pysty määrittämään tarkasti sikainfluenssan esiintymistä, vuodesta 2011 lähtien lääkärit olettavat edelleen usein, että heidän potilaillaan on sikainfluenssa, jos testin tulokset ovat positiivisia. Syynä tähän on se, että vuonna 2009 alkanut sikainfluenssapandemia on ollut niin laaja, että lääkärit päättelevät, että suurin osa ihmisistä todennäköisesti sairastaa sikainfluenssan, jos heillä todetaan influenssa. Sikainfluenssan ja muiden influenssatyyppien hoito on yleensä sama, ja tästä syystä lääkärit eivät yleensä huolehdi sikainfluenssatestauksesta useimmille ihmisille, jos he ovat muuten terveitä.
Jotkut lääkärit eivät vaivaudu testaamaan sikainfluenssaa tai muita influenssatyyppejä, vaan voivat diagnosoida sikainfluenssan potilaan oireiden perusteella. Syynä tähän on luultavasti se, kuinka laaja sikainfluenssa on levinnyt sen jälkeen, kun siitä tuli huoli vuonna 2009. Monet lääkärit sen sijaan, että vaivautuisivat PCR -testin tai nopean influenssadiagnostiikkatestin kanssa, kysyvät potilailtaan heidän oireistaan ja diagnosoivat sikojen flunssa, jos oireet näyttävät sopivan yhteen sairauden kanssa. Kaikkien influenssatyyppien, myös sikainfluenssan, on yleensä suoritettava kurssinsa, ja lääkärit määräävät yleensä potilailleen viruslääkettä nopeuttaakseen toipumisaikaa.