Olipa täytteenä tai päällekkäin, hedelmäjuustokakulla on makuja, jotka täydentävät juustokakun kermajuustotäytettä. Kirsikat, limetit ja persikat ovat joitakin vaihtoehtoja hedelmäjuustokakun luomiseen. Eksoottisempia hedelmiä, kuten mangoa, ananasta ja kookospähkinää käytetään myös hedelmäjuustokakun luomiseen. Juustokakku voi sisältää myös omenoita, karpaloita ja mansikoita.
Sitruunoiden maku sopii hyvin juustokakkuun, koska monet juustokakutäytteet sisältävät jo ripauksen sitruunamehua. Sitruunajuustokakku marjakastikkeessa sisältää manteli- ja taatelikuoren, joka on täytetty cashew -pähkinöistä, hunajasta ja sitruunamehusta. Marjakastike valmistetaan marjoista, jotka on sekoitettu taateliin tai hunajaan ja sekoitettu tasaiseksi. Sitruunajuustokakku sisältää makeutettua kondensoitua maitoa, neufchatel -juustoa ja munia. Se on maustettu vaniljalla, sitruunamehulla ja sitruunankuorella.
Omenoista voidaan valmistaa hedelmäjuustokakkua, kuten omenajuustokakkua, jossa on omenoita, ruskeaa sokeria ja kanelia. Syksyn omenajuustokakussa on graham -krakkausmuruja, hienoksi pilkottuja pekaanipähkinöitä ja sokeria. Viipaloidut omenat, jotka on päällystetty sokerilla ja kanelilla, kerrostetaan kermajuusto- ja sokeritäytteen päälle. Karamelli -omenajuustokakussa on graham -krakkausmuruja, jauhettua kanelia ja hienonnettuja pekaanipähkinöitä. Kermajuustotäytteen päälle on laitettu kuoritut omenat ja karamellijäätelö, kermavaahto ja hienonnetut pekaanipähkinät ennen tarjoilua.
Tuoreet ja purkitetut kirsikat ovat suosittuja täytteitä hedelmäjuustokakulle. Yksittäiset mini -kirsikkajuustokakut valmistetaan asettamalla vaniljakiekko cupcake -kääreen pohjalle ja kaatamalla sitten tuorejuustotäyte päälle. Ne keitetään, jäähdytetään ja sitten täytetään purkitettu kirsikkapiirakatäyte.
Mangoista, ananaksista ja persikoista voidaan valmistaa hedelmäjuustokakkuja. Mango -juustokakku valmistetaan lisäämällä mangoseos tuorejuustotäytteeseen. Persikkajuustokakku valmistetaan persikkagelatiinista ja suurista kypsistä persikoista. Ananasjuustokakku on valmistettu rasvattomasta tuorejuustosta, murskatusta ananasta ja sokerittomasta kermavaahdosta. Pina colada -juustokakku on valmistettu murskatusta ananasta, kookos- ja smetanaa, ja se on maustettu kevyellä rommilla ja kookosuutteella.
Hedelmiä, joissa on jonkin verran purenta, kuten karpaloita ja limeä, käytetään myös hedelmäjuustokakun luomiseen. Avain limetin juustokakku mansikkavoikastikkeessa sisältää tuorejuustoa, munia ja smetanaa. Se on maustettu limen kuorella, mansikoilla ja avaimen limemehulla. Pyöritetyssä karpalojuustokakussa on evästeen murusia ja voin kuorta. Kermajuustotäyte on maustettu kokonaisella marjakarpalokastikkeella, kanelilla ja neilikalla.