Peptiditeollisuudessa on mukana useita erilaisia yritystyyppejä. Lyhyet aminohappoketjut, joita kutsutaan peptideiksi, ovat avainreagensseja tai -reagensseja monissa tekniikoissa. Peptidit, jotka voidaan rakentaa aminohappojen kokoamisesta tai lyhyiden proteiinikatkelmien eristämisestä, valmistetaan peptidiyrityksen erittäin vaativien standardien mukaisesti.
Peptidiyritys tarjoaa usein erityisiä tuotteita ja palveluita. Sekvensointilaboratorio hyväksyy näytteet tuntemattomasta proteiinista ja määrittää kokeellisesti tämän proteiinin muodostavien aminohappojen lineaarisen järjestelyn. Näitä palveluja voidaan käyttää myös toisen yrityksen työn ulkopuolisena todentamisena.
Räätälöidyt peptidisynteesiyritykset valmistavat peptidejä asiakkaidensa vaatimusten mukaisesti. Tämä saavutetaan lisäämällä varovasti yksi aminohappo toisensa jälkeen määritetyssä järjestyksessä. Näistä yrityksistä tulee pian asiantuntijoita olosuhteissa, joissa aminohappoyksiköt lisäävät peptidihäntää. Tutkimusryhmä voi säästää huomattavia ponnisteluja tämän työn tekemisessä sen sijaan, että yrittäisi luoda kemikaaleja itse.
Toisenlainen peptidiyritys tukee teollisuutta tarjoamalla datakirjastoja. Katalogoidut tiedot kuvaavat peptidien fysikaalista rakennetta ja kemiallisia ominaisuuksia. Ne tarjoavat myös standardoituja testejä proteiinin puhtaudesta ja rakenteesta. Peptidikirjastopalvelut tukevat muun muassa lääkkeiden seulontaa, rokotteiden kehittämistä ja toimintarakenteiden tutkimuksia.
Peptiditoimittajat toimittavat puhdistettuja aminohappoja ja monia eristettyjä peptidejä tutkimusta ja pientä tuotantoa varten. Suurten peptidivalmistajien määrä on kasvanut, kun tutkimusta peptidien käytöstä lääkkeinä on jatkettu. Peptidiyritys, joka tuottaa peptidejä teollisesti hyvän tuotantotavan mukaisesti, tunnetaan GMP -laitoksena. GMP -sertifiointi ei suoraan tue prosessilinjan tuotteita; kuitenkin sertifioimalla peptidien valmistusmenetelmät, odotetut tulokset ovat laadukkaampia tuotteita.
Kaikki tämäntyyppiset peptidiyritykset luottavat muihin toimittajiin, jotka tarjoavat entsymaattisia reagensseja, puhdistettuja liuottimia, kemikaaleja ja analyysiohjelmistoja. Kaikkien reagenssien on oltava erittäin puhdistettuja peptidien säilyttämiseksi ja reaktioilmastoinnin aikaansaamiseksi, joka minimoi sivureaktiot. Peptidityössä käytetyt entsyymit ovat erittäin reaktiivisia ja niitä on käsiteltävä huolellisesti. Laadukkaat hartsitoimittajat tarjoavat hartseja, joita käytetään reaktiokohtina tai peptidien erottamiseen ja karakterisointiin. Toimialakohtaiset ohjelmistot auttavat peptidiyrityksessä suoritettavaa tunnistamista ja analysointia.