Useat eri tekijät voivat vaikuttaa etanolin hintaan. Tämä polttoaine on riippuvainen maataloustuotteesta, yleensä maissista tai sokerista, joten näiden perushyödykkeiden hinnalla voi olla suuri merkitys etanolipolttoaineen hinnan määrittämisessä. Muita etanolin hintaan vaikuttavia tekijöitä ovat tuotantokustannukset, kuljetuskustannukset, verot tai tariffit ja tuet. Jotkut näistä aiheuttavat hintapaineita, kun taas toiset pyrkivät alentamaan hintoja.
Jotta ymmärretään maataloushyödykkeiden hintojen merkittävä rooli etanolikaasun hinnassa, on hyödyllistä tietää, mikä vaikuttaa kyseisiin hyödykkeiden hintoihin. Kasvuolosuhteilla, kuten sairauksilla, säällä ja maaperällä, on kaikilla merkittäviä vaikutuksia hintaan. Kysynnän ja tarjonnan laki opettaa, että jos kysyntä pysyy samana tai kasvaa ja tarjonta kutistuu, kustannukset nousevat. Siksi kun olosuhteet pienentävät satoa, hinta nousee. Parempien vuosien aikana etanolin hinta voi todellakin laskea.
Vaikka näiden etanolin peruskomponenttien hinta on tärkeä, ne eivät ole niin epävakaita kuin monet saattavat ajatella. Maissi ja sokeri ostetaan usein sopimuksen mukaan, jolloin vältetään joitakin päivittäisiä hintojen muutoksia, joita varmasti tapahtuu. Siksi etanolin hinnat voivat pysyä suhteellisen vakaina, vaikka hyödykemarkkinoilla on suuria heilahteluja. Kun uusista sopimuksista neuvotellaan, etanolin hinnat voivat muuttua todennäköisemmin raaka -aineiden päivitettyjen hintojen vuoksi.
Toinen tärkeä tekijä etanolin hinnan määrittämisessä on kuljetuskustannukset. Etanolia on kuljetettava säiliöissä junissa ja kuorma -autoissa, koska se on niin syövyttävää. Tällaisia materiaaleja kuljettavia putkistoja on hyvin vähän. Siksi etanolilla on luontainen kustannusten nousu verrattuna tavalliseen bensiiniin ja öljyyn.
Kuljetuskustannuksia kompensoi jonkin verran se, että etanolille on monissa paikoissa myönnetty tukia ja verohelpotuksia. Tällaisia kannustimia on olemassa, koska jotkut hallitukset haluavat kannustaa etanolin käyttöä puhtaammin polttavana polttoaineena. Tämä auttaa alentamaan etanolin hintoja, vaikkakin keinotekoisesti.
Tämä keinotekoinen hintojen hallinta voi kuitenkin toimia molempiin suuntiin. Tullit ja muut etanolin verot ovat myös keinotekoisia hintavaikutuksia ja auttavat nostamaan hintaa ylöspäin, etenkin kun kyse on ulkomaisista etanolilähteistä. Esimerkiksi Brasilian etanoli olisi paljon halvempaa ostaa Yhdysvalloista, paitsi että sen tuonnille on asetettu tulli. Tämä tekee Brasilian etanolin hinnasta tasan tai jopa kalliimman kuin kotimaisen etanolin. Tämä ei ehkä hyödytä kuluttajia, mutta auttaa suojelemaan kotimaista teollisuutta.