Glutamiinijauheen käyttöön liittyy monia mahdollisia etuja ja hyvin vähän sivuvaikutuksia. Jotkut glutamiinijauheen eduista voivat sisältää ruokahalun hillitsemisen, arkuuden vähenemisen harjoitusten jälkeen ja parantuneen immuunitoiminnon. Glutamiinijauheen sivuvaikutukset liittyvät tyypillisesti sen mahdollisuuteen olla negatiivisesti vuorovaikutuksessa syövän hoitoon käytettävien lääkkeiden, kuten kemoterapialääkkeiden kanssa. Glutamiini voi myös vaikuttaa negatiivisesti munuaisten toimintaan ihmisillä, joilla on jo munuaisongelmia. Jauhetta ei myöskään pidetä tehokkaana, kun se liuotetaan kuumaan veteen, koska lämpö voi tuhota sen.
Ihmiset käyttävät usein glutamiinijauhetta yrittäessään laihtua ja tulla terveemmäksi. On mahdollista, että jauhe voi auttaa ruokahalun hillitsemisessä, erityisesti silloin, kun sokerin himo nousee. Ihmiset, jotka yrittävät laihtua, voivat hyötyä myös glutamiinijauheesta, kun he treenaavat säännöllisesti, koska jauheen tiedetään vähentävän harjoituksen jälkeen tyypillistä lihaskipua. Jauhe saattaa myös mahdollistaa harjoittelun pitkiä aikoja, koska lihaskipujen ja -kivujen aiheuttama pysäytystarve ei välttämättä ole yhtä painava.
Glutamiini voi lisäksi auttaa parantamaan kehon immuunijärjestelmän toimintaa. Monet sairaalat antavat glutamiinijauhetta potilailleen, jotka ovat joko kärsineet jonkinlaisista vakavista ruumiinvammoista tai joille on tehty leikkaus, koska jauhe pyrkii nopeuttamaan toipumisaikaa, mikä johtaa myös toisinaan lyhyempiin sairaalassaoloaikoihin. Keskimääräinen ihminen tuottaa paljon kortisolia minkä tahansa stressitilanteen sattuessa, varsinkin jos on tapahtunut vamma. Liian paljon kortisolia veressä voi poistaa glutamiinin, mikä voi vaikuttaa haitallisesti siihen, kuinka nopeasti ihminen paranee. Lääkärit toisinaan neuvoo potilaitaan jatkamaan glutamiinin ottamista muutaman viikon ajan sairaalasta vapautumisen jälkeen, mikä auttaa nopeuttamaan toipumisaikaa kotona.
Glutamiinijauheen sivuvaikutuksia tunnetaan hyvin vähän, mutta jotkut lääkärit neuvovat syöpäpotilaitaan välttämään sen ottamista, koska sillä voi olla kielteinen vaikutus kemoterapialääkkeiden tehokkuuteen. Glutamiinijauhe voi myös olla haitallista ihmisille, joilla on munuaisongelmia, vaikka jotkut lääkärit sallivat munuaispotilaidensa ottaa glutamiinia pieninä annoksina. Ihmisten, jotka käyttävät mitä tahansa reseptilääkettä, pitäisi luultavasti kysyä lääkäriltä ennen glutamiinin ottamista vain varmistaakseen, että se ei ole vuorovaikutuksessa negatiivisesti sen kanssa, mitä he käyttävät.