Hapan sylki voi johtua useista yleisistä ongelmista, joista osa on melko lyhytikäisiä ja toiset pidempiaikaisia. Tiettyjen elintarvikkeiden syöminen, tietyntyyppisten lääkkeiden ottaminen ja vitamiinin puutteet voivat kaikki johtaa hapan, huonomakuiseen sylkeen. Syynä voivat olla ikenen sairaus, tartunnan saaneet hampaat ja muut hammasongelmat. Usein syyllinen on anaerobisten bakteerien kertyminen kielen takaosaan, tilanne, jota voi pahentaa nenän jälkeinen tippuminen, krooninen suun kuivuminen tai yksinkertaisesti syljenerityksen väheneminen unen aikana. Ihmiset, joilla on närästys, voivat myös huomata hapan maun, koska happo ja sulattamaton ruoka tulevat takaisin suuhunsa.
Monissa tapauksissa hapan sylki on lyhyt ongelma, joka korjautuu itsestään, kun syy ei ole enää läsnä. Tiettyjen hapan tai voimakkaan makuisten elintarvikkeiden syöminen voi jättää hapan maun hetkeksi. Se voi olla tiettyjen lääkkeiden sivuvaikutus, mutta sen pitäisi ratkaista, kun lääkkeet lopetetaan. Tiettyjen vitamiinien, kuten B12, puutteet voivat aiheuttaa hapanta sylkeä, mutta tämä voidaan korjata lisäämällä ruokavalioon täydentää.
Hammasongelmat ovat toinen usein hapan syljen syy. Ihmiset, joilla on ikenitauti ja joissa ikenekudos turpoaa, tulehtuu ja tarttuu, voivat huomata, että sylki on hapan ja epämiellyttävä. Tartunnan saanut, paiseva hammas voi myös luoda hapan maun suussa olevien ylimääräisten bakteerien vuoksi.
Useimmille ihmisille bakteerien lisääntyminen suussa on hapan syljen takana. Tämä tapahtuu usein yksinkertaisesti siksi, että unen aikana syntyy vähemmän sylkeä sen hajottamiseksi, mikä johtaa hapan makuun ja pahanhajuiseen hengitykseen aamulla. Ihmiset, joilla on poskiontelotulehdus, voivat olla alttiimpia hapan syljelle, koska kielen takaosan limakalvot tarjoavat lisäproteiinia bakteereille, jotka voivat kasvaa sisään. Kroonista suun kuivumista sairastavilla voi myös olla ongelmia ylimääräisten bakteerien suussa; tila voi myös häiritä makuhermojen toimintaa, mikä voi pahentaa hapan maun vaikutelmaa.
Närästys voi myös olla hapan syljen takana. Ehto aiheuttaa mahahapon refluksointia ja joskus sulattamattomia ruokahiukkasia kurkkuun ja suuhun, missä ne voivat sekoittua syljen kanssa ja muuttaa sen hapan ja joskus katkeraksi. Tämä voi olla kertaluonteinen tai satunnainen ongelma, tai se voi olla jatkuva niille, joilla on krooninen sairaus.