Hypotalamuksessa on kolme osaa: etu-, putki- ja takaosa. Jokaisella osalla on oma roolinsa endokriinisen järjestelmän yleisissä toiminnoissa ja velvollisuuksissa. Yleisiin tehtäviin kuuluu liittyminen endokriiniseen ja hermostoon. Mikä tärkeintä, tämä pieni osa aivoista ylläpitää homeostaasia, joka ylläpitää sopivia olosuhteita, joita keho tarvitsee toimiakseen kunnolla.
Vaikka hypotalamus on pieni aivojen elin, sillä on suuria tehtäviä. Se on kartion muotoinen ja sijaitsee aivorungon yläpuolella, talamuksen alla. Tämä osa venyy alaspäin, kunnes se kohtaa infundibulaarisen varren, joka on putki, joka on liitetty aivolisäkkeeseen. Yleensä tällä elimellä on useita toimintoja, jotka on jaettu kolmeen osaan.
Koska hypotalamus on kytketty useisiin keskushermoston alueisiin ja limbisiin etuaivoihin, sen on sopeuduttava erilaisten sisäisten ja ulkoisten signaalien mukaan. Hajun stimulaatio vaikuttaa usein hormonitoimintaan. Glukokortikoidit ja steroidit vaikuttavat vasteisiin, kuten ruokahaluun tai janoon. Altistuminen päivänvalolle on ilmeinen signaali; se auttaa säätelemään unta ja heräämistä.
Hypotalamuksen etuosa sijaitsee edessä ja vastaa useista toiminnoista. Se on tärkeä osa lämmönsäätelyä, joka on kehon lämpötilan säätely. Lämmönsäätelyä ohjataan hikoilun ja huohottamisen avulla. Nukkumis- ja vuorokausivaiheita säätelee myös etuosa.
Hypotalamuksen keskellä on tubulaarinen alue. Tämä osa vastaa janoon ja nälkään. Tuberal -alue säätelee myös verenpainetta ja sykettä. Myös tämä alue säätelee kasvua sääteleviä hormoneja ja dopamiinin tuotantoa.
Hypotalamuksen takana on takaosa. Tämä alue hallitsee verenpaineen nousua, vilunväristyksiä ja pupillien laajentumista. Tämä alue vaikuttaa myös muistitoimintoihin.
Kokonaisuutena hypotalamus hallitsee monia tärkeitä kehon toimintoja. Tämä pieni aivojen elin hallitsee ja vapauttaa neurohormoneja. Näiden hormonien avulla hallitaan aivolisäkkeen toimintaa sekä koko autonomisen hermoston aineenvaihduntaprosesseja.
Hormonien ja aineenvaihdunnan hallinnan lisäksi hypotalamus myös kontrolloi ja vapauttaa hormoneja, jotka vaikuttavat hormonitoimintaan. Endokriiniset hormonit lähetetään aivolisäkkeeseen ja niillä on rooli tietyissä tunteisiin perustuvissa käytöksissä, kuten vihassa, ahdistuksessa tai pelossa ja seksuaalisessa toiminnassa.