Inuliinin sivuvaikutukset liittyvät tyypillisesti ruoansulatuskanavaan. Jotkut ihmiset voivat kokea vatsakipua ja kaasua, jos he käyttävät liikaa inuliinia. Muita yleisiä haittavaikutuksia ovat pahoinvointi ja ripuli. Yleensä sivuvaikutuksia ilmenee, jos ihmiset tietämättään syövät elintarvikkeita, joihin on lisätty inuliinia, tai ottavat inuliinilisää. Inuliini voi aiheuttaa allergisen reaktion joillekin ihmisille.
Inuliini on hiilihydraattityyppi. Sitä löytyy luonnostaan monista vihanneksista ja hedelmistä, kuten sipulista ja banaanista. Hiilihydraattia pidetään eräänlaisena liukoisena kuiduna, koska ruoansulatuskanava ei ime sitä. Sen sijaan se edistää terveiden bakteerien kasvua suolistossa. Koska se ei ole itse bakteeri, vaan vaikuttaa bakteerien määrään kehossa, sitä pidetään prebioottisena.
Inuliinin sivuvaikutukset ilmenevät yleensä vain silloin, kun henkilö kuluttaa liikaa kuitua päivän aikana. Testit ja tutkimukset ovat osoittaneet, että ihmiset osoittivat inuliinin ruoansulatuskanavan sivuvaikutuksia, kun he söivät sitä yli 10 grammaa päivässä. Tyypillisiä inuliinin käytön yhteydessä raportoituja sivuvaikutuksia olivat vatsakrampit, vatsan jyrinä ja ripuli. Jotkut ihmiset ilmoittivat turvotuksen tunteista sekä kaasusta ja ilmavaivoista.
Monet elintarvikevalmistajat lisäävät inuliinia elintarvikkeisiin, kuten vilja- tai jogurttiin, lisätäkseen kuitupitoisuutta tekemättä ruoan makua katkeraksi. Inuliinilla on tyypillisesti makea maku, joten sen lisääminen ruokaan ei ainoastaan lisää kuitua, vaan se voi myös parantaa ruoan makua. Kun yhä useammat valmistajat lisäävät kuitua elintarvikkeisiin, inuliinin sivuvaikutusten riski kasvaa, koska ihmiset voivat kuluttaa enemmän kuin on tarkoitettu huomaamatta sitä.
Inuliinia on saatavana myös lisäaineena tai injektiona, ja se on suunniteltu helpottamaan ummetusta tai alentamaan triglyseridipitoisuuksia, koska se estää kehoa absorboimasta triglyseridejä. Jotkut uskovat, että se voi auttaa alentamaan kolesterolia tai potilaita laihtumaan. Kun sitä käytetään ohjeena lisäaineena, inuliinin sivuvaikutukset ovat tyypillisesti vähäisiä tai niitä ei ole lainkaan.
Jotkut ihmiset voivat olla allergisia inuliinille. Allergisen reaktion merkit vaihtelevat allergian vakavuuden mukaan. Yleisiä allergiareaktioita ovat yskä tai hengitysvaikeudet kuitua sisältävän ruoan syömisen jälkeen, jopa vihannekset, jotka sisältävät luonnollisesti inuliinia. Kun kuitua lisätään yhä useampaan ruokaan, allergisten reaktioiden esiintyminen voi lisääntyä.