Kemiallisia torjunta -aineita on eri muodoissa, kuten rikkakasvien torjunta -aineita, jotka tappavat kasveja; hyönteismyrkyt, jotka tappavat hyönteisiä; ja avicides, jotka tappavat lintuja. Ne voivat vaikuttaa haitallisesti ilmaan, veteen ja maaperään, mikä puolestaan vaikuttaa ihmisten ja eläinten elämään. Pilaantumista ei aiheuta ainoastaan näiden kemikaalien käyttö, vaan myös epäasianmukainen varastointi, onnettomuudet tuotannon aikana ja epäasianmukainen käyttö.
Yleisin tapa saastuttaa ilmaa kemiallisilla torjunta -aineilla on tuulen kuljettamat hiukkaset muille alueille. Tämä on erityisen yleistä, kun käytetään ilmansuihketta. Hiukkaset kiinnittyvät ilmassa olevaan pölyyn, ja tuuli kuljettaa ne muille alueille, mahdollisesti saastuttaen villieläimiä ja muita kasveja. Jos on käytettävä kemiallisia torjunta -aineita, on mahdollista ryhtyä toimenpiteisiin estääkseen materiaalin leviämisen ilmassa. Puiden rajojen pitäminen ruiskutetun alueen ympärillä voi estää suuren osan kemiallisista torjunta -aineista leviämästä.
Kemialliset torjunta -aineet voivat myös löytää tiensä puroihin, jokiin, kaivoihin ja pohjaveteen. Tämä voi tapahtua vuotamisesta epäasianmukaisen varastoinnin, ylimääräisten torjunta -aineiden valumisen ja maaperästä pohjaveteen huuhtoutuvien kemikaalien vuoksi. Vesialueiden lähellä olevat alueet ovat vieläkin vaarassa. Kuten kemiallisten torjunta -aineiden aiheuttaman ilmansaasteen tapauksessa, voidaan ryhtyä toimenpiteisiin, joilla estetään suuria määriä saastuttamasta vettä, esimerkiksi varmistamalla, että riittävä määrä viljelykasveja istutetaan levityksen aikana ja yritetään välttää torjunta -aineiden ruiskuttaminen juuri ennen sadetta.
Monien mielestä kemiallisten torjunta -aineiden käyttö heikentää viljelysmaan maaperän laatua. Torjunta -aineissa olevat materiaalit saattavat aiheuttaa maaperän vähemmän luonnollisten asukkaiden läsnäoloa, mikä saattaa muuttaa maaperän kemiallista koostumusta. Lisäksi jos torjunta -aine jää maaperään, se ei ainoastaan voi huonontaa maaperän laatua, vaan se voi myös huuhtoutua pohjaveteen tai viedä tuulen mukana.
Kaikki nämä keinot levittää kemiallisten torjunta -aineiden aiheuttamaa saastumista voivat vaikuttaa ihmisiin ja villieläimiin. Se voi joutua juomaveteen, ruokaan tai sen päälle ja iholle, mikä voi saada heidät sairaiksi. Saastetasosta riippuen myös ihmishenkiä voidaan menettää. Tästä syystä on oltava varovainen aina, kun käytetään tai varastoidaan kemiallisia torjunta -aineita, jotta mahdollisimman vähän vahinkoa ympäröiville organismeille.