Ihmisen keskiaivojen eri alueet ovat yleensä vastuussa tajuttomista reaktioista ulkoisille ärsykkeille. Täällä käsitellään hermosignaaleja, jotka ovat peräisin monista ihmisen aisteista, mukaan lukien näkö, kuulo ja kosketus. Moottorin ohjaus – monet lihakset, joita tarvitaan minkä tahansa kehon liikkeen luomiseen – koordinoidaan tässä. Puolitajuiset huippu-urheilijat voivat kokea, mukaan lukien valppauden välittömän välittömyyden ja tarkan fyysisen vasteen, peräisin keskiaivojen monista osista, jotka toimivat tehokkaasti synkronisesti.
Anatomisesti ja toiminnallisesti ihmisen aivot on jaettu etu-, taka- ja keskiaivoihin. Jälkimmäinen alue on lähellä aivojen keskustaa, eikä enimmäkseen ole näkyvissä paitsi alapuolelta. Lääketieteellisesti sitä kutsutaan mesencephaloniksi. Yleensä sitä pidetään aivorungon laajentumisena ja laajentumisena, joka on vastuussa perustavanlaatuisimmista autonomisista toiminnoista, kuten sydämenlyönnistä, hengityksestä ja kasvusta. Nukkumispäätöksen jälkeen se säätelee lepoa ja kiihottumista välistä ohutta viivaa selviytymisen ja kasvun kannalta.
Keskiaivot ovat aivojen kehittynein alue. Vaikka ihmisillä on vaihtelevasti erittäin suuret etu- ja taka-aivot, kaikilla selkärankaisilla eläimillä, joilla on keskushermosto, on tämä aivojen perusrakenne. Sen yleinen arkkitehtuuri, osien organisointi on lisäksi sama, jopa fossiilisissa paleontologisissa eläimissä.
Yksi tämän selkärankaisten aivojen alueen merkittävimmistä osista on tectum eli corpora quadrigemina, joka on nimetty sen kvadranttirakenteesta. Kutakin neljää lohkoa kutsutaan colliculukseksi. Kunkin silmän pääasialliset näköhermon kimput kulkevat polkuja tektumin vastakkaisille puolille. Ylempi tai ylempi colliculi on kliinisesti osoitettu olevan vastuussa saccadic -silmien liikkeistä, silmälihasten nopeasta ja pienestä värähtelystä, joka mahdollistaa viivojen ja muotojen havaitsemisen. Alempi tai huonompi colliculi -pari vastaanottaa hermosignaalit, jotka laukaisee valon energia, ääni -aallot ja painovoima, jotka korvat rekisteröivät ja vastaanottavat niiden trochlear -hermot.
Aivokannat, suuret hermopaketit selkäytimen kummallakin puolella, edustavat toista merkittävää aivojen aluetta. Niissä ei ole vain opettavia efferenttisiä hermoja, kuten okulomotorinen neuroni, joka on vastuussa silmien pupillien laajentamisesta ja supistumisesta, vaan myös afferentteja hermoja kehon muista aistielimistä. Yksi tärkeimmistä hermosignaaleista on lämmön tunne, jonka suurelta osin rekisteröivät ihon herkät hermot. Keskiaivojen tehtävänä on käsitellä nämä kriittiset ympäristötiedot ja antaa korjaavia toimenpiteitä, kuten lihasten värinää.
Suuri osa aivojen pyrkimyksestä korjata kehon reaktio ulkoisiin ärsykkeisiin on kemiallinen, ei sähköisten signaalien päälle tai pois kytkin. Hypotalamus ja muut aivojen rauhaset erittävät katalyyttiset kemikaalinsa substantia nigraan, mustaan kudokseen aivokannan ytimessä. Yksi näistä hormoneista on dopamiini, jonka tiedetään vaikuttavan riippuvuuksiin sekä sellaisiin sivilisaation yhtä perusluonteisiin ihmisiin kuin itsemotivaatio ja sosiaalinen tottuminen.