Klomifeenin vaikutukset miehillä ovat lisääntynyt testosteronin tuotanto ja siten lisääntynyt siittiöiden tuotanto. Lääke vaikuttaa häiritsemällä järjestelmää, joka yleensä käskee aivolisäkkeen lopettamaan testosteronin tuotannon. Tämä järjestelmä käsittää aivolisäkkeen aivoissa ja Leydig -solut kiveksissä. Tutkimukset ovat osoittaneet, että klomifeenin käyttö miehillä ei ole yhtä tehokasta kuin naisilla – mutta tämä on sopusoinnussa niiden tietojen kanssa, jotka osoittavat, että parit eivät todennäköisesti tule raskaaksi, jos miehen on käytettävä hedelmällisyyslääkkeitä naisen sijaan. Yhdysvaltain elintarvike- ja lääkevirasto (FDA) ei ole hyväksynyt klomifeenia käytettäväksi miehillä.
Klomifeenin vaikutusten ymmärtäminen miehillä vaatii yleistä tietoa testosteronin tuotantoprosessista. Aivolisäke vapauttaa luteinisoivan hormonin (LH) hormonin, joka kuljetetaan Leydig -soluihin kiveksissä ja toimii kemiallisena viestinvälittäjänä. Leydig -solut vastaanottavat LH: n ja alkavat tuottaa testosteronia pumppaamalla sitä kehoon. Kehoon vapautunut testosteroni muuttuu estrogeeniksi, joka palaa takaisin aivolisäkkeeseen. Aivolisäke pitää ylimääräistä estrogeenia signaalina vähentää LH: n ja siten testosteronin tuotantoa.
Klomifeenin käyttö miehillä häiritsee tätä prosessia. Lääke estää estrogeenin pääsyn aivolisäkkeeseen, mikä saa aivolisäkkeen ajattelemaan, että elimistössä ei ole tarpeeksi testosteronia. Aivolisäke lähettää enemmän LH: ta alas kiveksen Leydig -soluihin, jotka reagoivat lisäämällä vielä testosteronia.
Tämän hormonaalisen prosessin sivutuote on johtanut klomifeenin käyttöön miesten siittiöiden määrän lisäämiseksi ja siittiöiden laadun parantamiseksi. Tämä voi tapahtua Leydig -solujen tuottaman ylimääräisen testosteronin seurauksena. Ylimääräinen testosteroni korjaa hormonitasoja, mikä voi johtaa terveempiin siittiöihin.
Huolimatta positiivisista testituloksista klomifeenin vaikutuksiin miehillä, lääke ei edelleenkään ole FDA: n hyväksymä käytettäväksi miehillä. Tämä johtuu siitä, että yritys, joka alun perin haki hyväksyntää, teki niin nimenomaan lääkkeen käytön naisille. Tutkimukset ovat osoittaneet, että pariskunnat, joissa mies tarvitsee hedelmällisyyshoitoja, tulevat raskaaksi vain 20–25 prosenttia ajasta, kun taas naiset käyttävät hoitoja 20–60 prosenttia.