Kombuchasta on raportoitu useita terveyshyötyjä, kuten immuunijärjestelmän paraneminen, maksan toiminnan parantuminen, parempi ruoansulatus ja syövän ehkäisy. Kun kombucha -tee on tullut suosittu, monet ihmiset ovat keskittyneet näihin väitteisiin. On tärkeää, kuten kaikkien villien elintarvikkeiden ja juomien kohdalla, tarkastella tutkimusta, joka voi tukea tällaisia väitteitä. Vaikka kombuchan eduista ja joistakin laboratoriotutkimuksista on saatu useita henkilökohtaisia raportteja, näitä etuja ei ole laajalti hyväksytty länsimaisessa lääketieteellisessä yhteisössä. Lisäksi on olemassa joitakin raportteja henkilöistä, joilla on haittavaikutuksia kombuchan juomisen seurauksena.
Vaikka suuri osa kombuchan etujen taustalla olevasta tieteestä on hieman pehmeää tai länsimaisen lääketieteellisen yhteisön hyväksymättä, monet ihmiset vannovat kombucha -teetä ihmejuomana. On myös viitteitä siitä, että idän ihmiset ovat nauttineet kombuchan eduista vuosisatojen ajan. Joillekin raportit siitä, että kombucha on parantanut ja edistänyt terveyttä niin pitkään, ovat riittävä todiste.
Koska tiede kombuchan eduista puuttuu, väitteet juoman kyvyistä ovat melko epämääräisiä. Ei ole mahdollista esimerkiksi väittää, että juoma parantaa mielenterveyttä, jos ei ole riittävästi todisteita tämän tosiasian tueksi. Laajoja väitteitä kombuchan eduista ovat parantunut yleinen terveys ja hyvinvointi sekä yllä luetellut. On kuitenkin mahdollista, että tulevaisuudessa todisteet joko vahvistavat tai löytävät reikiä näihin väitteisiin.
Kombuchan haittavaikutukset liittyvät yleensä vatsavaivoihin. Tämä voi johtua siitä, että juoma on melko hapan. Toisaalta monet ihmiset kertovat, että yksi kombuchan parhaista eduista on parempi ruoansulatus. Muut kombuchan haittavaikutukset voivat liittyä juoman viljelyyn käytettyyn tynnyriin tai purkkiin. Jos purkki on valmistettu materiaalista, kuten savesta, on mahdollista, että juoma pilaantuu lyijystä, joka on ainesosa, jota joskus käytetään tällaisten purkkien lasiteissa.