Koirien kuukautiset ovat osa estrus -sykliä, jossa hedelmällisyysajat vaihtelevat hedelmättömyyden ajan kanssa. Kun naaraskoira kokee kiertonsa hedelmällisen osan, hänen sanotaan olevan kuumassa. Koiran kuukautisten merkit vaihtelevat sen mukaan, minkä osan hedelmällisyysjaksosta naaraskoira kokee. Koirat aloittavat lämpöjaksonsa verisellä vuotolla emättimestään, ja tässä vaiheessa he houkuttelevat uroskoiria. Syklin hedelmällisimmässä vaiheessa verenvuoto yleensä pysähtyy ja naaraskoira sallii yhdynnän.
Lämmön ensimmäisessä vaiheessa, jota kutsutaan myös proestrusiksi, naaraskoira kokee turvotusta häpyynsä ja vuotaa kevyesti emättimestä. Tätä pidetään koirien yleisimpänä kuukautisten merkkinä. Verenvuoto ei kuitenkaan ole sama kuin ihmisen kuukautisten aikana, kun kohdun limakalvo irtoaa. Koirilla veri tulee emättimen seinämästä. Naaraskoirasta tulee houkutteleva uroskoirille proestrus -aikana, mutta hän ei salli heidän olla vielä yhdynnässä hänen kanssaan.
Ovulaatio tapahtuu toisen vaiheen alussa, joka tunnetaan nimellä estrus. Estruksen aikana naaraskoira on hedelmällisimmässä kohdassa. Hänen verenvuotonsa yleensä pysähtyy, ja hänen emättimen vuotonsa väri muuttuu joko kirkkaaksi tai oljen väriseksi. Koiran vulvan turvotus menee joskus pois tässä vaiheessa, mutta ei aina. Estruksen aikana naaraskoirasta tulee vastaanottavainen parittelulle.
Koirien kuukautisten kolmatta vaihetta kutsutaan diestrusiksi. Emättimen vuoto ja vulvan turvotus häviävät molemmat tässä vaiheessa, ja koira on joko raskaana tai kokee niin sanotun väärän raskauden. Vaikka koira ei olisi raskaana, hänen hormoninsä huijaavat kehoaan ajattelemaan, että raskaus on tapahtunut. Joskus diestrus -koirat yrittävät olla äitejä muille eläimille tai jopa leluille. Naaraspuoliset koirat, jotka kokevat diestrusta, eivät yhdy uroksen kanssa.
Anestrus on koirien kuukautisten viimeinen vaihe. Naaraskoirat anestesiassa eivät ole houkuttelevia uroskoirille eivätkä voi hyväksyä kavereita. Anestrus on ajanjakso, jonka aikana koiran lisääntymisjärjestelmä on lepotilassa voidakseen uudistaa itsensä siihen aikaan, jolloin koira on jälleen hedelmällinen.
Useimmilla roduilla kuukautiskierto koirilla kulkee suunnilleen kuuden tai kahdeksan kuukauden välein. Naaraspuoliset koirat pysyvät proestrusissa kahdeksan – 13 päivän ajan. Estrus kestää neljästä seitsemään päivään. Riippumatta siitä, onko koira raskaana, diestrus -vaihe kestää 70-80 päivää. Naaraskoiran anestesiavaihe kestää jopa 130 päivää.