Olisi vaikea luetella kaikkia kuumeen ja pahoinvoinnin syitä, koska niitä on tuhansia. Kuume auttaa itse asiassa päättämään, mikä voi johtaa pahoinvointiin tai haluun oksentaa, koska se poistaa tietyt asiat luettelosta. Yleensä pahoinvoinnin ja kuumeen yleisimmät syyt ovat ruoansulatuskanavan virustaudit ja loistaudit, amoebiset tai bakteeri -ruoansulatuskanavan infektiot. Joskus ihmiset tuntevat pahoinvointia kuumeessaan, vaikka heillä ei olisi minkäänlaista mahainfektiota.
Klassinen vatsatauti, jonka usein aiheuttaa rotaviruksiksi kutsuttu virusluokka, voi aiheuttaa kuumetta ja pahoinvointia samanaikaisesti joillakin ihmisillä. Nämä ovat harvoin ainoat kaksi tämän sairauden oireita. Monille ihmisille kehittyy myös vatsakipuja, kouristuksia, ripulia ja/tai oksentelua.
Vaikka useimmat ihmiset selviävät mahainfluenssasta ja toipuvat pahimmista oireistaan muutamassa päivässä, jos esiintyy liiallista oksentelua tai ripulia, erityisesti kuumetta, tämä voi johtaa nestehukkaan ja riski on suurempi nuorille, hyvin vanhoille tai lääketieteellisesti haavoittuva. Oksentamisesta tai ripulista, joka jatkuu yli puolen päivän ajan, tulee raportoida lääketieteellisesti haavoittuvilla potilailla, ja ihmisten, jotka ovat sairaita yli vuorokauden ja joilla on mahainfluenssan oireita, tulee myös ottaa yhteyttä lääkäriin, varsinkin jos kuume on yli 100.4 astetta F (38 astetta) ).
Toinen yleinen syy kuumeeseen ja pahoinvointiin on ameebi-, lois- tai bakteeri -infektiot, jotka johtuvat usein saastuneiden elintarvikkeiden nauttimisesta. Yksinkertaiset ruokamyrkytystapaukset voivat näyttää samanlaisilta kuin vatsatauti. Vakavampi sairaus voi aiheuttaa paitsi kuumetta ja pahoinvointia useiden päivien ajan, myös voimakasta oksentelua ja/tai ripulia. Jotkut näistä infektioista viipyvät ja aiheuttavat vatsavaivoja pitkiä aikoja, ja ne ovat erityisen huolestuttavia, kun vatsavaivat yhdistetään pitkäaikaiseen kuumeeseen. Tällaiset oireet ovat aina hyvä osoitus lääkärille.
Kun keho lämpenee, ihmiset voivat tuntea hikoilua, kipua, huimausta ja muuten epämukavaa. Siten käytännössä mikä tahansa kuume voi saada ihmiset tuntemaan itsensä epätoivoisiksi ja pahoinvoiviksi. Tämä voi tapahtua minkä tahansa virus- tai bakteeri -infektion aikana. Yleensä ihmiset voivat kertoa, että kuume, ei sairaus, aiheuttaa suoraan pahoinvointia, koska muut oireet osoittavat eri suuntaan.
On monia muita tiloja, jotka voivat aiheuttaa kuumetta ja pahoinvointia. Raskaana olevalla naisella, jolla on virus, voi olla molemmat nämä oireet. Jotkut paiseet, mahasyöpä, hormonaalinen epätasapaino ja muut olosuhteet voivat aiheuttaa myös nämä kaksi oirea. Muitakin esimerkkejä on olemassa. Nämä ovat yleensä harvinaisia verrattuna yleisempiin ja ennustettavissa oleviin syihin, joilla ihmiset pahoinvoivat vatsansa ja kehittävät kuumetta.