Lääketieteelliset ablaattorit ovat kemikaaleja ja instrumentteja, jotka altistavat kudokset äärimmäisille kylmille tai kuumille lämpötiloille. Kudokset kuolevat välittömästi altistuessaan kauteroinnille tai jäätymiselle, ja kirurgit voivat sitten helposti poistaa kudoksen. Ablaatiomenetelmät ovat yleensä vähemmän invasiivisia ja vaativat lyhyemmän toipumisajan kuin muut kirurgiset toimenpiteet. Lääkärit voivat suorittaa lääketieteellisen ablaation missä tahansa kehossa ihon pinnasta syvälle kudoksiin.
Sydänkirurgit suorittavat lääketieteellisiä ablaatiotoimenpiteitä käyttämällä alkoholia hypertrooppisen kardiomyopatian hoitoon. Potilailla, joilla on diagnosoitu tämä tila, esiintyy sydämen väliseinän paksuuntumista. Lääkärit suorittavat toimenpiteen tyypillisesti kataraatiolaboratoriossa potilaan ollessa hereillä mutta lievästi rauhoitettuna. Kuvatekniikan ohjauksella kardiologi pujottaa katetrin sydämeen johtavien verisuonten läpi. Katetrin läpi ruiskutettu alkoholi koskettaa paksuuntunutta seinämää tuhoamalla ja kutistamalla suurennettua kudosta.
Ihotautilääkärit käyttävät kemikaaleja dermabrasion- ja microdermabrasion -toimenpiteisiin. Tämäntyyppinen lääketieteellinen ablaatio aiheuttaa ihon kuorinnan. Kryoablaatiota argonkaasulla käytetään myös ei -toivotun biologisen kudoksen jäädyttämiseen nollan alapuolisiin lämpötiloihin. Kun kudos on jäädytetty, se kovettuu ja asiantuntijat käyttävät hiomaharjaa tai timanttipyörää kudoksen poistamiseksi kerroksittain. Potilaille voidaan tehdä pinnan ablaatio akne -arpien, hienojen juonteiden tai epänormaalin kasvun vuoksi.
Kirurgit käyttävät myös kryoablaatiota tuhoamaan sisäiset kasvaimet, joiden halkaisija on enintään 2 senttimetriä. Pienen viillon kautta lääkärit asettavat onton sauvan. Tietokonetomografian tai ultraäänen ohjaamana sauva saapuu kasvaimen paikkaan ja lähettää jäädytyskaasun kasvaimeen. Solut kuolevat kosketuksessa ja niistä tulee vaarattomia arpikudoksia.
Lääketieteelliseen ablaatioon liittyy joskus laser- tai radiotaajuushoitoja. Leikkauksen aikana lääkärit käyttävät lasereita perinteisten skalpellien sijaan kudosten polttamiseen ja leikkaamiseen verisuonten kauteroinnin lisäksi. Lasereita käytetään usein myös ajankohtaisissa kosmeettisissa toimenpiteissä. Radiotaajuuden ablaatio, joka tunnetaan myös nimellä Cobalation®, käyttää radioaaltojen ja suolaliuoksen yhdistelmää, mikä luo lämmitetyn plasmakentän kahden elektrodin väliin. Tämän plasmakentän alainen kudos höyrystyy välittömästi.
Kardiologia, gynekologia ja otolaryngologia ovat joitakin aloja, jotka poistavat epänormaalin kudoksen kontrolloidun radiotaajuisen ablaation avulla. Kardiologit korjaavat epänormaaleja sydämen rytmejä estämällä sydämen epäsäännöllisiä sähköreittejä. Gynekologit voivat poistaa kohdun fibroidikasvaimia käyttämällä Coblation® -valmistetta. Korva-, nenä- ja kurkkuasiantuntijat käyttävät tätä menetelmää tavallisesti risojen ja adenoidien poistamiseen tai uniapneaa tai kuorsausta aiheuttavien kitalaen vikojen korjaamiseen.