Mangaania käytetään monissa teollisissa metallurgisissa prosesseissa. Se on erityisen tärkeää teräksen ja alumiinin seosten luomisessa, mutta mangaanin käyttö ulottuu muille teollisuusalueille metallurgian ulkopuolella. Mangaani on tärkeä myös ravitsemuksessa. Ihmiskeho ei vaadi paljon tätä elementtiä, mutta useat mangaanin biologiset käyttötavat ovat kriittisiä kehon moitteettoman toiminnan kannalta, ja se sisältyy usein pieninä annoksina mineraalilisäaineisiin.
Merkittävin kaikista mangaanin teollisista käyttötarkoituksista on teräksen tuotanto, joka käyttää yli 85% kaikesta louhitusta mangaanista. Mangaania voidaan käyttää useissa eri seostamisprosesseissa teräksen kestävyyden parantamiseksi. Malmi on erityisen hyödyllinen teräksen hapettumiskestävyyden lisäämisessä, joten mangaania käytetään usein ruostumattoman teräksen valmistukseen. Mangaanin lisääminen teräkseen voi myös parantaa materiaalin kokonaislujuutta ja työstettävyyttä. Hadfield Steel on yksi esimerkki teräksen ja mangaanin seoksesta, ja se tunnetaan molemmista ominaisuuksista.
Myös muita metalleja voidaan seostaa mangaanilla. Alumiinin ja mangaanin seokset ovat melko yleisiä. Mangaani vahvistaa alumiinin korroosionkestävyyttä, ja yleisesti käytetään seoksia, jotka sisältävät noin 1% mangaania. Useimmille juomakuluttajille tutut alumiinitölkit valmistetaan juuri tällaisesta seoksesta.
Teollinen kemia käyttää myös mangaania. Mangaanin yleiset käyttötavat tällä alalla pyörivät sen käyttökelpoisuuden pigmenttinä. Maanväriset pigmentit sisältävät usein mangaania. Sitä voidaan käyttää samanlaisten sävyjen tuottamiseen, kun niitä lisätään tiileihin.
Kertakäyttöisissä alkaliparistoissa käytetään usein mangaania. Mangaani on katodi näissä paristoissa. Muita mineraaleja voidaan käyttää tähän tarkoitukseen, mutta mangaanin hinta ja kemialliset ominaisuudet tekevät siitä erittäin yleisen valinnan.
Mangaanilla on useita biologisia ja biokemiallisia käyttötarkoituksia. Suurin osa organismeista käyttää mangaania vain pieninä määrinä biologisissa prosesseissa. Ihmiskeho ei ole poikkeus tästä säännöstä.
Mangaani näyttää olevan erityisen tärkeä entsyymien moitteettoman toiminnan kannalta. Näillä entsyymeillä on erilaisia toimintoja. Jonkin verran apua kehon vaurioiden korjaamiseen. Muut ovat antioksidantteja. Muut entsyymit käyttävät mangaania tukemaan vahvojen ja terveiden luiden kehittymistä.
Kun otetaan huomioon mangaanin käyttökertojen määrä ihmiskehossa, se sisältyy usein mineraalilisiin. Pienet lisäannokset mangaania ovat joko hyödyllisiä tai vaarattomia. Keho ei kuitenkaan ole varustettu käsittelemään suuria määriä tätä mineraalia, ja suuremmissa annoksissa mangaani voi olla myrkyllistä.