Koiranomistajien, jotka ovat kiinnostuneita käyttäytymisongelmien luonnollisesta hoidosta, tulisi kysyä eläinlääkäriltä koirien melatoniinista. Melatoniini on neurohormoni, ja sitä voidaan käyttää rauhoittavana aineena tai koirien kohtausten hallitsemiseksi. Se voi myös auttaa säätelemään eläimen normaaleja kehon rytmejä. Koirille ei ole olemassa erityistä melatoniinivalmistetta. Se on valmistettu ihmisformulaatiossa, eikä FDA ole itse asiassa hyväksynyt sen käyttöä koirilla. Eläinlääkärit määräävät sen kuitenkin usein useille eri hoidoille koirilla ja voivat tehdä sen laillisesti. Melatoniini ei vaadi reseptiä. Ihmisen formulaatiota myydään tuotenimellä Melatonex, ja se löytyy yleisestä muodosta, joka on yksinkertaisesti merkitty melatoniiniksi.
Monet omistajat ovat onnistuneesti käyttäneet melatoniinia koirille, jotka ovat ahdistuneita tai joilla on muita käyttäytymisongelmia. Se voi auttaa rauhoittamaan koiran, joka pelkää kovia ääniä, kuten ukkosta, ilotulitusta tai muita ääniä. Lääkitys on usein määrätty koirille, jotka kärsivät eroahdistuksesta, kuten silloin, kun omistaja lähtee kotoa töihin. Jotkut koirat innostuvat liikaa yöllä ja alkavat vauhdittaa tai muutoin aiheuttavat haittaa kotitalouden yrittäessä nukkua. Melatoniini rauhoittaa koiran usein tarpeeksi, jotta se voi levätä. Yllättävä etu melatoniinista koirille on se, että se voi estää aivojen heikkenemistä tai dementiaa joillakin roduilla.
Melatoniinia tuotetaan luonnollisesti käpyrauhasessa, ja koiran melatoniini on yksinkertaisesti tislaus hormonista pillereinä. Sitä valmistetaan formulaatioissa, jotka vaihtelevat 300 mcg – 5 mg. Eläinlääkärin määräämän annoksen koko riippuu usein koiran painosta. Pienille koirille määrätään usein 0.5-1 mg, kun taas keskikokoisille koirille 1-3 mg ja suurille koirille 3-9 mg. Melatoniinia määrätään usein kahdeksan tunnin välein, joten koiralla voi olla jatkuvasti hormonijärjestelmää. Se on suurelta osin mautonta, ja kapselit voidaan rikkoa auki ja ripotella ruoan päälle. Koska melatoniini on luonnollinen aine, se on erittäin turvallinen eläimelle, ja yliannostus on erittäin epätodennäköistä.
Koirien melatoniinilla on hyvin vähän sivuvaikutuksia. Pienellä määrällä eläimiä on tiedetty olevan allerginen reaktio melatoniinille. Koska se vaikuttaa kehon järjestelmien rytmiin, sillä voi olla kielteinen vaikutus naaraspuolisten koirien lisääntymissykliin. Kasvattajien ja omistajien, jotka haluavat kasvattaa lemmikkinsä, tulisi olla tietoisia tästä. Melatoniini voi myös olla vuorovaikutuksessa muiden lääkkeiden kanssa koiran järjestelmässä. Koska se toimii usein rauhoittavana rauhoittavana aineena, sitä ei tule käyttää yhdessä rauhoittavien aineiden kanssa. Omistajan tulisi keskustella eläinlääkärinsä kanssa muista lääkkeistä, joita heidän koiransa käyttää ennen melatoniinin antamista.