Useimmat mustan ripulin tapaukset johtuvat ruoansulatuskanavan verenvuodosta. Veri näkyy eri tavalla ulosteessa riippuen ruoansulatuskanavan kohdasta, josta verenvuoto on peräisin. Tässä tapauksessa verenvuoto esiintyy yleensä mahalaukussa tai ruokatorvessa, ja se muuttuu mustaksi, kun se kulkee kehon ruoansulatusmehujen läpi. Näiden alueiden verenvuoto voi johtua haavaumista, gastriitista ja liiallisesta oksentelusta. Musta lakritsi, raudan lisäravinteet ja tietyt elintarvikkeet voivat myös aiheuttaa mustan ripulin, samoin kuin ylimääräiset lääkkeet, kuten vismuttia sisältävät.
Tekninen termi mustasta ripulista, joka on peräisin ylemmästä suoliston verenvuodosta, on melaena. Kun veri kulkee ruoansulatuskanavan läpi ja joutuu kosketuksiin ruoansulatusmehujen kanssa, veren rauta muuttuu, mikä johtaa mustaan väriin. Vaikka ruokatorvi ja vatsa ovat yleisimpiä verenvuodon aiheuttajia, ja lääkärit katsovat yleensä sinne ensin, on myös mahdollista, että verenvuoto alkaa suolistossa, kuten ohutsuolessa tai paksusuolessa.
Haavaumat määritellään haavaumiksi, jotka muodostuvat iholle ja estävät elimen toimintakykyä. Mahahaava tai mahahaava ovat haavaumia, jotka muodostuvat mihin tahansa ruoansulatuskanavan limakalvoon ja voivat olla erittäin kivuliaita ruoansulatuskanavan happaman ympäristön vuoksi. Vaikka useimmat mahahaavat johtuvat Helicobacter pylori -bakteerin kroonisesta infektiosta, ne voivat johtua myös liiallisesta alkoholinkäytöstä tai ei-steroidisten tulehduskipulääkkeiden (NSAID) pitkäaikaisesta käytöstä. Näissä tapauksissa musta ripuli on usein merkki mahahaavasta, joka on alkanut vuotaa verta.
Gastriitti on samanlainen kuin mahahaava, mutta se määritellään yleisemmin ruoansulatuskanavan limakalvon tulehdukseksi. Monet mahahaavoja aiheuttavat olosuhteet voivat myös aiheuttaa gastriittia, erityisesti alkoholia ja tulehduskipulääkkeitä, mutta gastriitti voi ilmetä myös stressin, tiettyjen autoimmuunisairauksien tai leikkauksen vuoksi. Erityisesti krooninen gastriitti voi liittyä Crohnin tautiin, maksakomplikaatioihin tai munuaisten vajaatoimintaan. Pitkäaikainen tai vaikea mahalaukun tulehdus voi lopulta johtaa verenvuotoon ja siten mustaan ripuliin.
Liiallinen oksentelu tai yskä, joka tunnetaan erityisesti Mallory-Weissin oireyhtymänä, voi johtaa repeämään ylemmässä ruoansulatuskanavassa, erityisesti mahalaukun ja ruokatorven välisessä risteyksessä. Mallory-Weissin oireyhtymässä esiintyvä vakava, väkivaltainen ärsytys liittyy useimmiten syömishäiriöiden ja alkoholismin puhdistamiseen, mutta kaikki olosuhteet, joihin liittyy akuuttia oksentelua, voivat johtaa tähän tilaan. Yleensä potilaat löytävät ruokatorven repeämän yskimällä tai oksentamalla verta, mutta musta ripuli toimii myös merkkinä verenvuotosta, joka on yksinkertaisesti kulkenut vastakkaiseen suuntaan.
Tietyt elintarvikkeet voivat myös aiheuttaa hyvänlaatuisen värimuutoksen ulosteessa, kuten mustan lakritsin liiallinen kulutus tai elintarvikkeet, joissa on paljon eläimen verta. Raudan lisäravinteet voivat myös aiheuttaa ulosteen mustan tai joskus vihertävän värin. Vismuttisubsalisylaatti, kemikaali, jota käytetään yleisimmin ruoansulatushäiriöiden hoitoon, voi myös johtaa vaarattomaan värin muuttumiseen mustaksi ulosteeksi, koska ruoansulatuskanavassa on rikkiä. Näissä tapauksissa lääkitys tai ruoka saa ulosteen muuttumaan luonnollisesti mustaksi; ripuli on todennäköisesti riippumaton tästä värinmuutoksesta ja sen aiheuttaa toinen tekijä.