Kolme yleisimpiä organisaatiorakenteen malleja ovat toiminnallinen, matriisi ja jaettu tai tuote. Jokainen näistä hierarkkisista järjestelmistä auttaa yritystä järjestämään resurssit ja vastuut. Kunkin rakenteen perimmäinen tarkoitus on tarjota puitteet johdonmukaiselle työskentelylle yrityksen tavoitteiden saavuttamiseksi.
Toiminnallinen rakenne on yksi perinteisimmistä organisaatiorakenteen malleista. Se jakaa vastuun virkaan. Tyypillisessä kaaviossa, jossa esitetään tämä järjestelmä, yrityksen toimitusjohtaja tai toimitusjohtaja (toimitusjohtaja) olisi ylhäällä ja kaikki muut alla luetellut tehtävät. Tämän rakenteen tasojen määrä riippuu yrityksen koosta ja valvontatehtävien organisoinnista. Pienyrityksellä voi olla vain yksi taso yrityksen pään alapuolella, kun taas suuremmilla organisaatioilla voi olla useita sivuliikkeitä sekä pysty- että vaakasuunnassa.
Divisioona- tai tuoterakenne on tehtäväpohjaisin organisaatiorakenteen malleista. Yrityksen pään alla on luokka jokaiselle suurelle tuotteelle tai palvelulle. Alla on identtiset luokat markkinoinnin, myynnin, ostamisen ja varaston osalta. Yksittäiset tuotelinjat toimivat itsenäisinä yksiköinä. Presidentti tai toimitusjohtaja valvoo sitten jokaista linjaa.
Matriisirakenne on olennaisesti kahden edellisen organisaatiorakenteen mallin yhdistelmä. Hierarkisen puun yläosa muistuttaa toiminnallista rakennetta, jossa presidentti tai toimitusjohtaja on ylhäällä ja sitten useita muita tehtäviä suoraan alla. Puun vasemmassa alakulmassa luetellaan kaikki tuotelinjat tai palvelutarjonta pystysuunnassa, toisin kuin jakorakenteen vaakasuunta.
Tuoteluettelon jokaisen tarjouksen oikealla puolella kunkin tarjouksen tuottamiseen tarvittavat vaiheet on järjestetty vaakasuoraan, ja osio kuuluu jokaisen työnimikkeen alle. Nimikkeet on järjestetty toiminnon mukaan palvelun luomis- tai tarjoamisprosessissa ja kaikkien muiden tuotesyklin osien hallinnassa. Tämä voi sisältää esimerkiksi kehitys-, valmistus- ja markkinointivaiheita. Jokainen näistä alueyksiköistä on omavarainen ja raportoi yrityksen johtajalle tai kenties aluepäällikölle, joka sitten kommunikoi yrityksen toimiston kanssa.
Vaikka monet organisaatiot käyttävät yhtä näistä kolmesta mallista, niitä voidaan myös muuttaa vastaamaan yrityksen erityistarpeita. Rakennetta voidaan muuttaa vastaamaan yrityksen tarpeita alusta alkaen tai organisaation muuttuessa. Esimerkiksi pienen tai keskikokoisen yrityksen voi olla käytännöllisempää käyttää yksinkertaista toiminnallista rakennetta, mutta se käyttää muutamia jakautuneen rakenteen elementtejä kasvaessaan.