Kasvihuone voidaan tuulettaa monella eri tavalla, mutta jotkut menetelmät ovat tehokkaampia kuin toiset. Parhaat kasvihuoneilmanvaihtomenetelmät mahdollistavat ilman virkistämisen hellävaraisesti häiritsemättä sen sisäistä hellävaraista kasvillisuutta. Yksi yksinkertaisimmista tuuletusmenetelmistä on kattoon tai seinään asennettava tuuletusaukko, joka mahdollistaa luonnollisen tuulen virtaamisen rakenteen läpi. Automaattisesti avautuvat ja sulkeutuvat tuuletusaukot ovat myös hyvä tapa kasvihuoneilmanvaihtoon. Pakokaasu- ja sisäkiertoilmapuhaltimet voivat olla tehokas tapa tuulettaa myös kasvihuone.
Yksi seinään tai kattoon asennettu tuuletusaukko on yksi halvin ja paras kasvihuoneilmanvaihto. Tällainen tuuletusaukko mahdollistaa raikkaan ilman virtaamisen rakenteen läpi avoimesta ovesta tai ikkunasta. Tämä kasvihuoneen tuuletusmenetelmä sallii ilman virtaamisen vähitellen huoneen läpi ja poistaa lämmön ja kosteuden. Suuremmat kasvihuoneet vaativat yleensä sarjan tuuletusaukkoja, jotka on sijoitettu strategisesti katolle tai seinille. Seinän tuuletusaukot voidaan avata manuaalisesti lisäämään ilmavirtaa, kun tuulta ei puhalla.
Automaattiset tuuletusaukot avautuvat ja sulkeutuvat, kun kasvihuoneen lämpötila saavuttaa tietyn tason. Tämä kasvihuoneilmanvaihto toimii ilman sähköä. Kiinnitetty sylinteri avaa tuuletusaukon automaattisesti, kun sen ympärille kertyy riittävästi lämpöä. Tuuletusaukko sulkeutuu uudelleen, kun kasvihuoneen ilma on jäähtynyt. Sähkötoimisia automaattisia tuuletusaukkoja ohjataan termostaatilla tai kosteudensäätimellä, joka on esiasetettu tiettyyn lämpötila- tai kosteustasoon.
Pakokaasupuhaltimet voivat myös tuoda kasvihuoneen ilmanvaihtoa vetämällä ulkoilmaa rakenteen läpi, kun luonnollista tuulta ei ole. Nämä puhaltimet asennetaan tyypillisesti ovea vastapäätä, jotta ilma pääsee virtaamaan kokonaan rakenteen läpi. Koska poistoilmapuhallin puhaltaa ulospäin, se ei häiritse herkkiä kasveja. Pienet kasvihuoneet voidaan yleensä tuulettaa vain yhdellä seinäyksiköllä. Suuremmat rakenteet voivat vaatia yhden tai useamman suuren poistoilmapuhaltimen, jotka on asennettu kumpaankin päähän ja joissa on tuuletusaukot sivuseinissä.
Poistoilmapuhaltimia voidaan ohjata manuaalisesti tai automaattisesti termostaatin tai kosteudensäätimen avulla. Voidaan myös ostaa aurinkokäyttöisiä pakopuhaltimia energiankulutuksen vähentämiseksi. Näillä yksiköillä on korkeammat alkukustannukset, mutta ne maksavat yleensä itsensä takaisin ajan mittaan alentamalla sähkökustannuksia. Jotkut kasvihuoneet käyttävät sisäpuhallinta yhdessä poistoilmapuhaltimen kanssa ilman kiertämiseksi edelleen ja vähentävät lämpötilaa ja kosteutta. Tämä kasvihuoneilmanvaihtomenetelmä auttaa myös edistämään tietyntyyppisten kasvien pölytystä.