Avoimen lähdekoodin verkkoneuvottelut antavat käyttäjille mahdollisuuden osallistua kokouksiin, seminaareihin ja muihin konferenssityyppisiin aktiviteetteihin Internetin kautta, mutta käyttäjien tulee noudattaa joitain etikettivinkkejä. Käyttäjien tulee ilmoittaa itsensä ensimmäisten keskustelujen yhteydessä, kunnes kaikki osallistujat ovat tutustuneet toisiinsa. Jos käyttäjän on puhuttava sellaisen henkilön kanssa, joka ei liity verkkoneuvotteluun, mikrofoni on mykistettävä. Avoimen lähdekoodin verkkoneuvotteluohjelmassa järjestelmänvalvojan tulee tunnistaa ohjelman koodi ja tuntea käyttäjäyhteisö. Kun käyttäjä puhuu ja käyttää verkkokameraa, hänen tulee katsoa kameraan eikä tietokoneen näyttöön.
Avoimen lähdekoodin verkkoneuvotteluissa ei ole harvinaista, että osallistujat, jotka eivät tunne toisiaan, kokoontuvat yhteen. Tämä tarkoittaa, että se voi hämmentää joitain käyttäjiä, kun joku alkaa puhua, koska he eivät ehkä tiedä, kuka puhuja on. Oikea etiketti edellyttää, että jokaisen käyttäjän on ilmoitettava itsestään ensimmäisten puheidensa yhteydessä, joten kaikki tietävät, kuka puhuu. Jos konferenssi on tarkoitettu liiketapaamiseen, käyttäjien tulee myös ilmoittaa kantansa.
Ei ole harvinaista, että jonkun puhelin soi tai joku muu kuin konferenssiin liittyvä henkilö yrittää puhua käyttäjän kanssa avoimen lähdekoodin verkkoneuvottelun aikana. Tämä voi johtaa hankaliin ja häiritseviin keskusteluihin, joilla ei ehkä ole mitään tekemistä konferenssin kanssa. Jotta häiriötekijät pysyisivät mahdollisimman vähäisinä, käyttäjän tulisi mykistää mikrofoni näissä tapauksissa – tai välttää tällaiset tapaukset kytkemällä soittoääni pois päältä ja ilmoittamalla toimistossa oleville ihmisille, että hän on hetken aikaa poissa käytöstä.
Järjestelmänvalvojien ja vähäisemmillä säännöllisillä käyttäjillä pitäisi olla tietoa avoimen lähdekoodin verkkoneuvotteluohjelman lähdekoodista ja sen ohjelmointikielestä. Lähdekoodia voidaan tutkia ja muuttaa avoimen lähdekoodin ohjelmassa, jonka avulla käyttäjät ja järjestelmänvalvojat voivat optimoida verkkoneuvotteluohjelman nopeuden tai tehon mukaan ja auttaa korjaamaan toimintahäiriöt. Verkkoneuvottelujen käyttäjäyhteisöön tutustuminen voi myös auttaa korjaamaan mahdolliset ongelmat.
Monilla käyttäjillä on tapana katsoa tietokoneen näyttöä, kun he osallistuvat verkkoneuvotteluun, varsinkin jos he käyttävät verkkokameraa. Jos käyttäjät tekevät tämän puhuessaan, näyttää kuitenkin siltä, että he katsovat toiseen suuntaan eivätkä kiinnitä huomiota. Käyttäjät voivat sen sijaan haluta katsoa suoraan verkkokameraan, koska se näyttää siltä, että he katsovat suoraan muita käyttäjiä.