Kesäkurpitsaa säilytettäessä on oltava varovainen. Kesäkurpitsa on osa vähähappoisia vihanneksia tunnettua vihannesryhmää, mikä tarkoittaa, että on toteutettava asianmukaiset ja täsmälliset säilykkeet, jotta kaikki haitalliset bakteerit tapetaan. Kun säilytät kesäkurpitsaa, on parasta käyttää mahdollisimman tuoreita kesäkurpitsaa, työskennellä nopeasti, pakata kesäkurpitsa löysästi kuumiin purkitölkkeihin ja kuumentaa ja sulkea se painekattilassa riittävän kauan tappaakseen kaikki haitalliset bakteerit. Vaikka kesäkurpitsa on mahdollista säilyttää, monet asiantuntijat suosittelevat sen sijaan jäädyttämistä, koska he uskovat tämän menetelmän olevan turvallisempaa.
Aloittaaksesi kesäkurpitsojen säilykkeen, tarvitset mahdollisimman tuoretta kesäkurpitsaa. Kun hedelmät ja vihannekset istuvat sadonkorjuun jälkeen, ne alkavat menettää makuaan, tekstuuriaan ja väriä eri entsyymien hajoamisen vuoksi. Jos kesäkurpitsaa ei ole mahdollista käyttää heti sadonkorjuun jälkeen, kesäkurpitsa jäällä tai jääkaapissa saattaa auttaa säilyttämään vihanneksen ennen säilöntää. Vaikka kesäkurpitsaa pidetään kylmänä, on parasta käyttää sitä säilykkeeksi mahdollisimman pian.
Kun on aika valmistaa kesäkurpitsa säilykkeitä varten, leikkaa vihannes yhtenäisiksi viipaleiksi. Vältä viipaleiden istumista liian kauan, koska ne alkavat värjäytyä. Kesäkurpitsaviipaleet tulee sitten laittaa kattilaan, jossa on vettä, ja kiehauttaa. Poista keitetyt kesäkurpitsa ja aseta se lämmitettyihin lasipurkkeihin ja täytä purkit nesteellä, jolla käytettiin kesäkurpitsaa. Kesäkurpitsa on pakattava löysästi purkkeihin, jotta se kuumenee tasaisesti painekypsennysvaiheen aikana.
Kun kesäkurpitsa on valmistettu ja lisätty purkkipurkkeihin, tiivisteet ja kannet on asetettava purkkeihin. Tässä vaiheessa purkit ovat valmiita käsiteltäväksi painekattilassa, jotta ne sulkevat ja auttavat tuhoamaan kaikki haitalliset bakteerit. On olemassa erilaisia mielipiteitä siitä, kuinka kauan säilykkeen kesäkurpitsaa käsitellään, mutta monet asiantuntijat sanovat käsittelevän purkit vähintään 30 minuutin ajan.
Kesäkurpitsan peittaus on toinen tapa säilyttää kesäkurpitsaa. Jotkut uskovat, että tämä valmiste on turvallisempaa kuin yksinkertaisesti vihannesten valkaisu ennen kuin laitat sen purkkipurkkeihin. Muita menetelmiä kesäkurpitsajen säilyttämiseksi ovat viipaleiden valkaisu ja viipaleiden asettaminen pakastinpusseihin tai muihin ilmatiiviisiin astioihin. Jotkut raastavat kesäkurpitsaa valmistettaessa leivontaan ympäri vuoden, raastavat raastetut palat ja laittavat ne pakastesäiliöihin. Kesäkurpitsasta valmistetut astiat voidaan myös pakastaa, jolloin yksilö voi säilyttää kesäkurpitsaa ja saada aterioita valmiiksi syötäväksi pakastimesta.