Munakoiso voidaan säilyttää onnistuneesti huoneenlämmössä, jääkaapissa tai pakastimessa. Tämä hedelmä on herkkä, joten jotkut sen varastointiprosessit voivat viedä aikaa. Käytetty säilytystyyppi voi kuitenkin vaikuttaa suoraan siihen, kuinka kauan munakoiso pysyy tuoreena.
Munakoiso on teknisesti hedelmä, vaikka monet uskovat sen olevan vihannes. Se on yökerhon eli Solanaceae -perheen jäsen. Tämä hedelmä on erimuotoinen ja -kokoinen, ja munakoison ihonväri riippuu yleensä munakoisotyypistä ja tavasta, jolla sitä viljellään. Nahat vaihtelevat väriltään ja voivat näyttää valkoisilta, vihreiltä, keltaisilta, violetilta tai jopa mustilta; joskus se on myös pilkullinen tai monivärinen. Hedelmän sisäpuoli on vihreä, kun se on ennenaikainen, ja valkoinen, kun se on kypsä.
Kun säilytät munakoisoa huoneenlämmössä, jääkaapin ulkopuolella, hedelmät on pidettävä kokonaisina. Se huononee nopeasti huoneenlämmössä, jos iho on leikattu. Kokonaan säilynyt munakoiso säilyy kuitenkin tuoreena jopa kolme päivää.
Jääkaapin käyttö voi pidentää tämän hedelmän käyttöikää. Jos munakoisoa ei leikata, sitä voidaan säilyttää jääkaapissa enintään viisi päivää. Ennen kuin munakoisoa säilytetään tällä tavalla, yksilöiden on kuitenkin aina poistettava kaikki muovikääreet ja puhdistettava ne lämpimällä vedellä. Kun asetat munakoisoa jääkaappiin, on tärkeää käsitellä hedelmiä varoen, jotta ne eivät lävistä ihoa millään tavalla. Munakoiso tulee sijoittaa jääkaapin pohjalle; rapeaa laatikkoa käytetään useimmiten munakoisoa säilytettäessä, koska se on lämpimämpää kuin muu jääkaappi.
Munakoisojen pitkäaikainen varastointi edellyttää pakastimen käyttöä. Tässä menetelmässä munakoiso on pestävä, yläosat on leikattava pois ja se on kuorittava. Sen voi sitten leikata paloiksi ja liottaa kiehuvan veden ja sitruunamehun seokseen. Kun seoksen on annettu kiehua tässä seoksessa hieman alle viisi minuuttia, se voidaan laittaa jääveteen kypsennysprosessin lopettamiseksi.
Kun säilytät munakoisoa pakastimessa, voit käyttää tyhjiö- tai pakastuspusseja. Pakastuspussit voivat säilyttää hedelmät tuoreina jopa viisi kuukautta. Tyhjiöpussit pitävät munakoisot hyvänä jopa 14 kuukautta. Kun hedelmiä tarvitaan, ne voidaan sulattaa ja keittää.