Säilykkeet ovat yleinen tapa säilyttää tuoreet punajuuret. Kotisäilykkeet tarjoavat ihmisille mahdollisuuden säilyttää juurikassato tai ostaa juurikkaita irtotavarana kauden aikana ja säilyttää ne ympärivuotiseen käyttöön. Juurikkaiden kotiäilykkeet edellyttävät oikein toimivan painesäiliön ja punajuurien käyttöä kauden ja tuoreuden alkaessa. On myös välttämätöntä valmistaa ja pakata punajuuret oikein, joko kokonaisina tai viipaleina, ennen kuin säilytät ne.
Ennen sokerijuurikkaan tai muiden vähähappoisten elintarvikkeiden säilymistä henkilön on varmistettava, että painekeitin toimii kunnolla, mukaan lukien mittarin tarkkuus. Virheellinen mittari saattaa vaatia vaihtamista varmistaakseen, että juurikkaat käsitellään oikein. Tavallisia punajuuria ei pitäisi yrittää purkkiin kiehuvaan vesihauteeseen perustuvalla menetelmällä, koska tämä ei riitä tappamaan bakteereja, jolloin punajuuret ovat alikäsiteltyjä ja alttiita pilaantumiselle. Poikkeuksena tähän ovat peitatut juurikkaat, jotka voidaan säilyttää turvallisesti kiehuvaan vesihauteeseen peittausprosessin lisääntyneen happamuuden vuoksi. Henkilö, jolla ei ole painesäiliötä eikä halua peitellä niitä, voi jäädyttää juurikkaat turvallisena vaihtoehtona.
Kun valitset punajuurta säilykkeitä varten, henkilön tulee olla varma, että sen halkaisija on enintään 1–2 tuumaa (2.54–5 cm), koska suuret punajuuret ovat yleensä liian kuituisia ja sitkeitä. Parhaat punajuuret säilykkeitä varten ovat tumman, syvänpunaisia ja ilman ihon tahroja tai vaurioita. Henkilön, joka säilyttää puutarhasta korjattuja juurikkaita, tulisi yrittää kerätä ne kerralla ja säilyttää niitä vain pari päivää ennen säilytystä. Varret, juuret ja iho on jätettävä ehjiksi. Koko punajuuri on keitettävä vain, kunnes kuoret irtoavat helposti, noin 15–25 minuuttia koosta riippuen.
Punajuurikuoret on helpompi luiskahtaa pois, jos henkilö kuorii ne juoksevan kylmän veden alla, vaikka punajuuret olisi pyrittävä pitämään kuumina. Ole varovainen kuoriessasi juurikkaita, koska mehu tahraa nopeasti vaatteet, laskurit sekä puu- ja muovipinnat. Punajuurien säilyminen kokonaisuudessaan on parasta vauvan juurikkaille, kun taas keskikokoiset tai suuret punajuuret säilyvät parhaiten kuutioina tai viipaleina. Kuumat punajuuret on pakattava kuumiin pint- tai quart-kokoisiin purkkeihin jättäen 1 cm: n (2.54 tuuman) päätilaa sen jälkeen, kun kiehuva vesi on kaadettu juurikkaiden päälle. Juurikkaat tulee sitten käsitellä painekanisterissa valmistajan ohjeiden mukaisesti.