Rekisterin eheytysohjelman on tarkoitus parantaa tietokoneen nopeutta järjestämällä rekisteritiedostoja. Parhaan tuloksen saavuttamiseksi on tärkeää ladata ja asentaa hyvämaineinen rekisterin eheytysohjelma sen sijaan, että se olisi haittaohjelma. Voi myös olla hyödyllistä varmuuskopioida Windows® -rekisteri ennen uuden ohjelman suorittamista, jos jokin menee pieleen. Lisäksi monet asiantuntijat ovat eri mieltä rekisterin eheyttämisen tai puhdistamisen tärkeydestä, ja on mahdollista, että tämäntyyppinen Windows® -optimointi nopeuttaa merkityksettömästi tai ei ollenkaan. Siksi, jos tietokoneen käyttäjä haluaa lisätä tietokoneen nopeutta, siihen on olemassa muita luotettavampia menetelmiä, jotka voivat olla myös ilmaisia tai halpoja.
On olemassa satoja rekisterin eheytysohjelmia ilmaiseksi tai kertamaksulla. Kuten virustentorjuntaohjelmat, kaikki nämä eheytysohjelmat eivät ole turvallisia asentaa, ja varovaisuutta on noudatettava uuden ohjelmiston valinnassa. Jotkut ohjelmat ovat haittaohjelmia, jotka ilmoittavat vääriä rekisterivirheitä ja vaativat tietokoneen käyttäjää maksamaan niiden poistamisesta. Nämä ohjelmat ja niitä myyvät verkkosivustot käyttävät usein pelottelutaktiikkaa; esimerkiksi ponnahdusikkuna voi sanoa, että käyttäjän tietokone on skannattu ja kriittiset virheet on korjattava välittömästi. Tietokoneen käyttäjää kehotetaan yleensä ostamaan kallis korjausohjelma tietokoneen vaurioiden tai merkittävän hidastumisen estämiseksi.
Kun tietokoneen käyttäjä on löytänyt hyvämaineisen ohjelman, jolla on positiivisia arvosteluja, hän voi varmuuskopioida rekisterin. Jos rekisterin varmuuskopiointi vahingoittaa tiedostoa tai sotkee rekisterin jollakin muulla tavalla, rekisterin varmuuskopioinnin avulla tiedostot voidaan palauttaa alkuperäiseen tilaansa. Jotkut rekisterin apuohjelmat kehottavat käyttäjää automaattisesti varmuuskopioimaan rekisterin ja voivat jopa pystyä tekemään sen itse, mutta muut ohjelmat jättävät tämän tehtävän kokonaan käyttäjän tehtäväksi. Normaalisti, jos ohjelmistolla ei ole tätä ominaisuutta, Windows® -käyttöjärjestelmä voi tehdä sen sen sijaan.
Lopuksi, onko tietokoneen käyttäjän muokattava rekisteriä ollenkaan, on kiistanalainen kysymys. Monet asiantuntijat väittävät, että rekisterinpuhdistajat ja defrags eivät lisää suorituskykyä merkittävästi, ja joku, joka ei tunne Windows® -rekisteriä, voi helposti vahingoittaa sitä. On myös lukuisia tapoja parantaa tietokoneen suorituskykyä ilman, että sinun tarvitsee säätää herkkää järjestelmää. Esimerkiksi jotkut keinot tietokoneen suorituskyvyn parantamiseksi ovat bloatware-ohjelmien poistaminen, siirtyminen vähemmän resursseja härisevään virustorjuntaohjelmaan ja tietokoneen asettaminen olemaan avaamatta harvoin käytettyjä ohjelmia käynnistyksen yhteydessä.