Sairauksien tartuntariskin minimoimiseksi ruiskua tulee käyttää vain kerran ja steriloida ennen uudelleen käyttöä, jotta mikrobit tai sairaudet eivät pääse potilaiden välillä. Ruisku on upotettava vain yhteen lääkepulloon ja asetettava sitten yhteen henkilöön tai eläimeen ennen purkamista ja sterilointia. Paras tapa steriloida ruisku on altistuminen korkealle lämmölle, vaikka ruiskun steriloinnissa voidaan käyttää useita kemikaaleja, kun asianmukaisten laitteiden käyttö ei ole mahdollista.
Paras tapa suorittaa ruiskujen sterilointi on käyttää autoklaaveiksi kutsuttuja koneita, joita löytyy usein sairaaloista ja laboratorioista, joissa niitä käytetään monenlaisten laitteiden sterilointiin. Näihin koneisiin voidaan laittaa lasiruiskuja, joita käytetään enää harvoin, ja lämmittää ne 248–120 asteen lämpötilaan 15-20 minuutiksi. Muoviruiskut voivat vaurioitua tässä kuumuudessa ja ne on yleensä suunniteltu heitettäväksi pois yhden käytön jälkeen. Injektioiden antamiseen käytetyt neulat voidaan laittaa näihin koneisiin sterilointia varten ja käyttää uudelleen. Pienet lääkäritoimistot tai klinikat, joilla ei ole omaa autoklaavia, lähettävät usein saastuneet ruiskut asianmukaiseen sterilointiin ja hävittämiseen.
Autoklaavissa lämpötila nousee huomattavasti korkeammaksi kuin kiehuvan veden lämpötila. Silti kiehuvat lasiruiskut ovat yksi tapa suorittaa ruiskujen sterilointi. Tämä menetelmä ei ole yhtä tehokas kuin autoklaavin käyttö ja voi levittää tautia, koska se ei välttämättä tappaa kaikkia itiöitä. Tätä menetelmää tulisi käyttää vain hätätilanteessa. Pieni määrä fenolialkoholia tulee lisätä veteen steriloinnin parantamiseksi. Kun vesi kiehuu, lasiruisku tulee jättää 15-20 minuutiksi.
Muoviruiskut on yleensä suunniteltu hävitettäviksi yhden käytön jälkeen. Tästä huolimatta voi syntyä tilanteita, joissa henkilön on käytettävä ruiskua uudelleen. Tässä tapauksessa ruiskun steriloinnin parhaat vinkit sisältävät ruiskun huuhtelun vedellä ja valkaisuainetta.
Jotta ruisku voidaan steriloida vedellä ja valkaisuaineella, ruisku on täytettävä puoliväliin seoksella ja ravistettava voimakkaasti ennen nesteen suihkuttamista. Tämä prosessi on toistettava, kunnes ruiskusta ei löydy verta tai lääkettä, ennen kuin se huuhdellaan pois useita kertoja puhtaalla vedellä. Tämä ei poista kaikkia viruksia, bakteereja tai muita epäpuhtauksia, ja se tulisi tehdä vain hätätilanteessa, kun steriili ruisku ei ole käytettävissä.