Monet ihmiset ovat kiinnostuneita hoitamaan naturopaattisia parannuskeinoja erilaisiin lääketieteellisiin ongelmiin, erityisesti tapauksissa, joissa perinteinen lääketiede ei ehkä ole ollut tehokas. Naturopaattisten parannuskeinojen yrittämisessä on kuitenkin useita etuja ja haittoja, jotka ovat erittäin tärkeitä pitää mielessä. Suurin haittapuoli on se, että tietyt vaihtoehtoiset hoidot eivät ehkä ole tehokkaita ja voivat jopa aiheuttaa enemmän haittaa kuin hyötyä pitkällä aikavälillä; se voi myös saada ihmiset väärin uskomaan, että he paranevat, ja lopettaa määrätyn lääkityksen ottamisen tai käymisen lääkärin luona. Jotkut naturopaattisen lääketieteen ammattilaiset sisältävät kuitenkin sen, että sivuvaikutuksia on vähän tai ei lainkaan, ja että se edistää yleisesti terveellisempää elämäntapaa, varsinkin kun se yhdistetään muihin tavanomaisiin hoitoihin ja lääkärin valvontaan.
Monissa tapauksissa lääkärit suosittelevat kokeilemaan naturopaattisia parannuskeinoja perinteisen lääketieteen lisäksi, ei sen sijaan. Tällä tavalla lääkäri voi määrittää, voisiko jokin luonnollisista hoidoista mahdollisesti häiritä muita lääkkeitä tai terveydentilaa, ja voi jatkaa edistymisen seurantaa. Vaikka naturopaattinen hoito on ”luonnollista”, se ei automaattisesti tarkoita, etteikö se voisi olla vuorovaikutuksessa muiden lääkkeiden kanssa, joita henkilö käyttää. Tämä voi itse asiassa aiheuttaa haittaa ja pahentaa tiettyjä olosuhteita. Naturopaattisten parannuskeinojen kokeilu lääkärin johdolla varmistaa myös, että henkilö jatkaa määrätyn lääkkeen ottamista ja osallistuu määräaikaisiin lääkärikäynteihin; tämä johtuu siitä, että vaikka vaihtoehtoiset hoitomuodot eivät ole aktiivisesti haitallisia, jotkut voivat yksinkertaisesti olla tehottomia.
Luonnollisesti myös luonnollisilla parannuskeinoilla on monia mahdollisia etuja. Ensimmäinen on se, että monet vaihtoehtoiset hoidot edistävät yleistä terveyttä ja vähentävät stressiä. Esimerkiksi tasapainoisen ruokavalion syöminen, joogan harjoittaminen ja akupunktion saaminen voi olla vain yleisesti hyödyllistä ja mahdollisesti jopa estää tulevia lääketieteellisiä ongelmia. Lisäksi naturopaattiset hoidot rohkaisevat potilasta ottamaan aktiivisen roolin sairautensa perimmäisen syyn ymmärtämisessä ja ryhtymään toimiin sen hoitamiseksi ja ehkäisemiseksi. Sen sijaan, että hoidettaisiin vain oireita, naturopatia pyrkii hoitamaan koko kehoa, ja jotkut asiantuntijat uskovat, että tällä lähestymistavalla voi olla aktiivinen rooli taistelussa.
Naturopaattiset hoidot ovat usein halvempia kuin perinteinen lääketiede, joten niiden sisällyttäminen budjettiin tai elämäntapaan voi olla helpompaa. Toisaalta on kuitenkin hyvin vaikeaa löytää sairausvakuuttajaa, joka maksaisi vaihtoehtoisista lääketieteellisistä hoidoista, joten se saattaa tulla kalliiksi hoitosuunnitelmasta riippuen. Monille ihmisille kannattaa kuitenkin maksaa nämä kustannukset, jotta he voivat täydentää sairaanhoitoaan ja hoitaa sairauksiaan monitahoisella lähestymistavalla.