Prostaglandiinien vaikutukset sileisiin lihaksiin mahdollistavat hormonin käytön glaukooman ja tiettyjen iskeemisten sairauksien hoitoon. Tyydyttymättömistä rasvahapoista koostuvat prostaglandiinit säätelevät ionivirtausta solutasolla ja niitä voidaan käyttää työvoiman indusointiaineena. Ei-steroidiset tulehduskipulääkkeet (NSAID) toimivat tyypillisesti prostaglandiiniantagonisteina kuumeen, tulehduksen ja kivun vähentämiseksi. Nämä toimet aiheuttavat usein myös ruoansulatuskanavan häiriöitä. Prostaglandiinien käyttö samanaikaisesti tulehduskipulääkkeiden kanssa vähentää mahdollisia mahahaittavaikutuksia.
Travaprost kuuluu prostaglandiinianalogeiksi kutsuttujen lääkkeiden ryhmään, jotka jäljittelevät lipidiyhdisteiden vaikutuksia. Lääkitys on yleensä määrätty vastustamaan silmänpainetta, joka liittyy yleisesti avoimen kulman glaukoomaan. Formulaatiossa olevat prostaglandiinianalogit lisäävät tehokkaasti uveoskleraalista ulosvirtausta ja alentavat painetta. Kun laskimonsisäisesti annetaan, iskeemisistä häiriöistä kärsiville, mukaan lukien Reynaud’n oireyhtymä, esiintyy vähemmän ja harvemmin hyökkäyksiä. Prostaglandiinien sileiden lihasten rentoutumisen aiheuttamat verisuonia laajentavat vaikutukset lisäävät verenkiertoa ja vähentävät iskemiaan liittyviä oireita.
Lääkärit voivat käyttää PGE1: tä tai alprostadiilia ylläpitääkseen valtimotiehyen aukon imeväisillä, joilla on diagnosoitu nämä sydänsairaudet, ennen leikkausta. Ductus sallii yleensä veren virtauksen keuhkovaltimosta ohittaa keuhkot ja kulkea takaisin aorttaan syntymättömillä lapsilla. Tämä venttiili sulkeutuu normaalisti pian syntymän jälkeen, mutta voi aiheuttaa stressiä imeväisille, jotka kärsivät sydän- tai keuhkohäiriöistä. Tämän aukon säilyttäminen vähentää sydämen kuormitusta ja ohittaa vialliset suonet.
Miehet, joilla on erektiohäiriö, voivat myös saada reseptin Alprostadilille. Koska lääkitys yleensä rentouttaa valtimoiden sileitä lihaksia, veren virtaus penikseen lisääntyy. Kun verenkierto on riittävä tai lisääntynyt, miehet saavuttavat yleensä erektion. Lääkitys voidaan pistää suoraan peniksen kavernosaan tai lisätä pelletin muodossa virtsaputken aukkoon.
Emättimen geeli- tai peräpuikkomuodossa annettava lääke dinoprostoni aiheuttaa tyypillisesti synnytystä. Prostaglandiinihormonit, jotka tunnetaan nimellä PGE2, rentouttavat kohdun sileitä lihaskudoksia, jotka kypsyttävät kohdunkaulan aiheuttamalla laajentumista ja ohenemista. Valmiste yleensä myös käynnistää kohdun supistukset. Synnytyslääkärit voivat myös käyttää PGE2: ta synnytyksen jälkeen kohdun sävyn ylläpitämiseksi. Kun kohtu menettää sävynsä tai kykynsä supistua kunnolla, verenkierto lisääntyy, mikä voi aiheuttaa verenvuotoa.
Tulehduskipulääkkeet yleensä estävät prostaglandiinien vaikutuksia. Jotkut näistä vaikutuksista suojaavat normaalisti ruoansulatuskanavan herkkää limakalvoa. Näitä suojaavia ominaisuuksia lukuun ottamatta voi esiintyä haavaumia. Misoprostoli on prostaglandiinianalogi, joka lisää bikarbonaattia ja liman tuotantoa. Lisääntynyt limakalvojen suoja vähentää tulehduskipulääkkeiden aiheuttaman sisäisen vamman todennäköisyyttä.