Yleisimmin käytetty aidan materiaali on historiallisesti ollut puu, mutta kun enemmän vaihtoehtoja tulee saataville, yhä vähemmän aitoja valmistetaan puusta. Kuten muillakin materiaaleilla, puisilla aitapylväillä ja muilla puuaitausmateriaaleilla on omat etunsa ja haittansa, mutta useimmissa kotikäytössä puiset aidatolpat toimivat täydellisesti parantamaan pihan esteettisyyttä ja tukemaan aidan paneeleja. Puiset aidatolpat on myös helpompi asentaa kuin muut materiaalit, koska pylväät voidaan leikata pituiksi asennuksen jälkeen, jos pylvään mitat jäävät pois jostain syystä.
Ehkä paras materiaali puuaidan pylväille on setri, koska se on luonnostaan vettä ja hometta kestävää. Cedar on myös näkyvästi kaunis, ja se voi olla myös melko tuoksuva. Estetiikan lisäksi setri vääntyy vähemmän, koska se kestää kosteutta ja on epätodennäköisempi mädäntymään nopeasti samasta syystä. Cedar on kuitenkin kalliimpaa kuin muut puulajit, ja vaikka setriä ei tarvitse aluksi värjätä tai maalata, se on ehkä maalattava useiden vuosien kuluttua, koska se on altis haalistumaan suorassa auringonvalossa.
Toisin kuin vinyylipylväät, puiset aidatolpat ovat melko anteeksiantavia asennuksen aikana. Jos pylväs on asennettu väärin – se on ehkä liian korkea – se voidaan leikata pituudeksi betonijalan asettumisen jälkeen. Vinyylipylväät ovat esivalmistettuja, kuten useimmat metallipylväät, mikä tarkoittaa, että pylvään korkeutta ei voi helposti säätää. Aitapaneelien kiinnittäminen puisiin aitapylväisiin on myös melko yksinkertaista, mikä on etu verrattuna vinyylipylväisiin, jotka on esivalmistettu tiukkojen toleranssien mukaan, joita on noudatettava asennuksen aikana. Puiset pylväät voidaan myös himmentää helposti, jos kahden pylvään välinen etäisyys on suurempi kuin pitäisi.
Puuaidan esteettisyyttä voidaan myös muuttaa melko helposti maalaamalla tai värjäämällä. Puiset aidatolpat on käsiteltävä ensin vedenkestävällä kemikaalilla, ja sen lisäksi aitapylväät voidaan edelleen suojata elementeiltä maalaamalla tai värjäämällä. Vedenpitävät ja vedenkestävät maalit ja tahrat löytyvät helposti rauta- tai maalikaupoista, ja voit valita, minkä värin tai minkä värisen tahran hän haluaa aidalle. Puupylväs voidaan maalata usein uudelleen aidan ulkonäön muuttamiseksi. Vaikka tämä on varmasti etu, pylväiden maalaaminen voi olla myös haitta, koska ne on yleensä maalattava muutaman vuoden välein, jotta ne eivät näytä kuluneilta tai huonontuneilta.