Seleeniä voidaan käyttää joko värin lisäämiseen tai poistamiseen lasista. Sitä käytetään myös monissa elektronisissa laitteissa ja kopiokoneissa. Seleeniä voidaan käyttää myös pigmenttien valmistukseen tietyille materiaaleille, erityisesti lasitteille, ja sitä voidaan käyttää metalliseosten parantamiseen. Yksilöiden on myös nautittava tietty määrä seleeniä pysyäkseen terveinä, ja sen tekemättä jättäminen voi johtaa moniin terveysongelmiin. Yksi seleenin käyttötarkoituksista sisältää seleenilisien valmistuksen.
Yksi yleisimmistä seleenin käyttötarkoituksista on lasin valmistus. Kun lasia valmistetaan, rautaoksidiepäpuhtaudet jättävät vihertävän sävyn. Tämän värimuutoksen estämiseksi lisätään usein seleeniä. Kirkas punainen lasi, kuten jarruvalossa, voidaan valmistaa myös seleenistä. Tämän vaikutuksen aikaansaamiseksi on kuitenkin käytettävä suuri määrä seleeniä.
Seleeniä pidetään puolijohteena. Tämä tarkoittaa, että se johtaa jonkin verran sähköä, mutta se ei johda yhtä paljon sähköä kuin johdin. Elektroniikkateollisuudessa seleenistä valmistettuja puolijohteita käytetään usein transistoreissa.
Toinen seleenin suosituimmista käyttötarkoituksista on valokopioiden tekeminen. Tiettyjen kopiokoneiden sisällä olevat rummut tai vyöt on usein peitetty seleenillä. Yhdessä valojen, peilien, väriaineen ja lämmön kanssa tämä mineraali voi luoda lähes identtisiä kopioita asiakirjoista.
Seleeniä käytetään joskus myös keramiikan valmistuksessa. Yksi seleenin käyttötarkoituksista on pigmenttien valmistus. Riippuen siitä, kuinka paljon tätä mineraalia käytetään, oransseista punaisiin lasitteisiin voidaan tehdä keraamisia kappaleita. Seleeniä voidaan käyttää myös värin lisäämiseen joihinkin muoveihin.
Ihmiskeho tarvitsee tietyn määrän seleeniä pysyäkseen terveenä. Seleeniä löytyy tyypillisesti maaperästä tai vedestä, ja sitä löytyy myös tietyistä elintarvikkeista. Brasilian pähkinät ovat yksi tämän mineraalin parhaista lähteistä, mutta tonnikala ja naudanliha sisältävät myös kunnollisia määriä seleeniä. Valitettavasti joillakin alueilla ympäri maailmaa, kuten Kiinassa, ei ole tarpeeksi seleeniä.
Yksilöt, jotka eivät saa riittävästi seleeniä ruokavaliossaan, voivat olla alttiita seleenipuutoksille. Henkilö, jolla on seleenipuutos, voi sitten kehittää hypotyreoosiksi kutsutun tilan, joka ilmenee, kun kilpirauhanen ei tuota riittävästi hormoneja. Tämä sairaus voi johtaa muihin terveysongelmiin, mukaan lukien sydänongelmat ja heikko immuunijärjestelmä. Suurimpia seleenin käyttötarkoituksia ovat myös seleenilisien valmistus, mikä voi auttaa seleenipuutoksista kärsiviä ihmisiä.