Silmätipat voivat aiheuttaa monia erilaisia sivuvaikutuksia, mutta sivuvaikutusten erityisluonne riippuu usein tippojen lääkityypistä. Silmätipat voivat ärsyttää silmän pintaa, vaikka tippa on suunniteltu vähentämään ärsyttäviä oireita, kuten punoitusta tai kutinaa. Silmätipat voivat myös aiheuttaa päänsärkyä, vatsavaivoja, uneliaisuutta ja ärtyneisyyttä. Jotkut lääkinnälliset silmätipat voivat vahingoittaa henkilön silmiä, jos niitä käytetään liian kauan.
Silmätippojen yleisiä sivuvaikutuksia ovat punoitus ja ärsytys. Nämä oireet voivat ilmetä silmän pinnalla ja mennä pois, kun käyttäjä tottuu lääkkeeseen, tai ne voivat pahentua, jos potilas ei siedä lääkitystä hyvin. Pistely, polttaminen, turvotus ja tunne, että jotain silmissä voi esiintyä myös silmätippojen sivuvaikutuksena.
Jotkut silmätipat aiheuttavat pupillin laajentumisen tai supistumisen. Nämä oireet voivat olla tilapäisiä, yleensä kestäviä noin pari tuntia, vaikka jotkut silmätipat voivat luoda tämän vaikutuksen koko niiden käytön ajan. Nämä vaikutukset voivat johtaa valoherkkyyteen. Tähän liittyviä silmätippojen sivuvaikutuksia ovat keskittymisvaikeudet ja näön hämärtyminen.
Silmätipat voivat vaikuttaa myös muihin kehon järjestelmiin. Päänsärky on yksi yleisimmin raportoiduista silmätippojen sivuvaikutuksista, mutta myös vatsavaivoja, kuten ripulia ja pahoinvointia, voi esiintyä. Nämä haittavaikutukset eivät ole yleisiä, ja ne näkyvät useimmiten lääkkeitä luovuttavien silmätippojen sijaan lääkkeettömien tippojen kanssa.
Silmätipat voivat myös vaikuttaa sydän- ja keuhkojärjestelmään. Nopeita sydämenlyöntejä ja hengitysvaikeuksia voi esiintyä tietyntyyppisten tippojen kanssa, kun taas toiset johtavat hitaampaan hengitykseen ja sykkeeseen. Muuten terveellä potilaalla ei yleensä ole vakavia komplikaatioita näistä silmätippojen sivuvaikutuksista, mutta potilas, jolla on jo olemassa oleva sydänsairaus, saattaa pahentaa tätä tilaa.
Jotkut silmätipatyypit voivat vahingoittaa vakavasti silmiä. Anestesiapisarat voivat vahingoittaa sarveiskalvoa ja dekongestanttiset silmätipat voivat aiheuttaa glaukooman, usein nopeasti ja ilman varoitusta. Potilaiden, jotka kokevat äkillisen näönmuutoksen, on otettava yhteys lääkäriin viipymättä, koska jotkut näistä tiloista voivat heikentää näköä pysyvästi.