Sovellettu käyttäytymisanalyysi on yksi yleisimmin käytetyistä autismin hoidoista; Jotkut todisteet osoittavat, että se on onnistunut lähestymistapa. Tämä menetelmä on kuulemma tehokkain, kun sitä käytetään oikein ja vähintään 36 tuntia, mutta mieluiten 40 tuntia viikossa. Usein ehdotetaan, että sovellettu käyttäytymisanalyysi parantaa sosiaalisia taitoja, kieli- ja kommunikaatiotaitoja, akateemisia taitoja ja minimoi toistuvaa käyttäytymistä. Nämä tulokset ovat kuulemma parantaneet joitakin emotionaalisia ahdistusongelmia autismin kärsimissä. Sovelletun käyttäytymisen analyysin arvostelijat väittävät, että hoidon tehokkuuden vuoksi tarvitaan pitkiä työpäiviä ja asianmukaisesti koulutettuja ammattilaisia, mikä voi olla kallista.
Aika, joka tarvitaan soveltuvan käyttäytymisanalyysin tehokkaaseen hyödyntämiseen autismissa, on pitkä. Ammattiterapeutin on ehkä vietettävä yli 40 tuntia viikossa autistisen potilaan kanssa. Tämä voi joskus vaikeuttaa vanhempien löytämistä käytettävissä olevasta terapeutista. Oikean terapeutin valinta voi olla avainasemassa. On tärkeää tarkistaa viitteet ja tarkistaa pätevän terapeutin pätevyys, koska tämän tyyppisen hoidon tehokkuus ei ehkä ole yhtä korkea ilman asianmukaista koulutusta.
Sovellettu käyttäytymisanalyysi autismista voi auttaa parantamaan kielitaitoa ja viestintätaitoja prosessin avulla, jossa käyttäytymistä havaitaan ja kehotteita käytetään auttamaan potilasta kommunikoimaan muiden kanssa. Sanallisia käyttäytymistekniikoita käytetään usein kielen sujuvuuden lisäämiseen. Oikeaa käyttäytymistä vahvistetaan palkinnoilla, jotka voivat olla niin pieniä kuin hymy tai tunnustus ja yhtä suuria kuin fyysinen palkitsemisjärjestelmä. Sujuvuuden rakentamisharjoituksia käytetään yleisen kommunikointitaidon antamiseen.
Toistuvaa käyttäytymistä voidaan vähentää käyttämällä autismin käyttäytymisanalyysiä sekä lapsille että aikuisille. Terapeutti palkitsee halutun käyttäytymisen jättämättä huomiotta toistuvaa käyttäytymistä eikä olennaisesti palkitse sitä. Tämäntyyppinen hoito voi kestää viikkoja, ellei kuukausia, tulosten huomioimiseksi. Joissakin tapauksissa voi kestää vuosia, ennen kuin positiiviset tulokset näkyvät. Sovellettu käyttäytymisanalyysi perustuu johdonmukaisuuteen; tämä on syy siihen, että positiivisten tulosten saavuttamiseksi tarvitaan usein useita tunteja hoitoa.
Jotkut kriitikot vastustavat sovelletun käyttäytymisanalyysin käyttämistä autismissa. He voivat ehdottaa, että se on liian kallista monille perheille. Vaikka monet myyntipisteet ja organisaatiot tukevat autismia käsitteleviä perheitä, tämäntyyppisen hoidon vaatima taloudellinen taakka voi joissakin tapauksissa olla suuri.