Yleisin tetrasykliinihydrokloridin käyttö on bakteeri -infektioiden hoito. Tetrasykliinihydrokloridi on laajakirjoinen antibiootti, joka on tehokas grampositiivisia ja gramnegatiivisia bakteereja vastaan. Tämä antibiootti estää proteiinisynteesiä bakteerissa. Sitä käytetään myös usein luubiopsioissa luun kasvun indikaattorina.
Monet erilaiset infektiot reagoivat hyvin tetrasykliini -antibioottihoitoon. Se on määrätty ylä- ja alahengitysteiden tulehduksiin. Tätä lääkettä käytetään menestyksekkäästi sellaisten ihoinfektioiden hoitoon, joita ei aiheuta stafylokokibakteerit. Kalliovuorten täplikäs kuume ja kolera ovat yleisiä infektioita, jotka on hoidettu onnistuneesti tetrasykliinihydrokloridilla. Tetrasykliinihoito on parantanut myös pernaruttoinfektioita.
Tetrasykliini on myös määrätty joidenkin sukupuolitautien hoitoon. Sitä käytetään esimerkiksi silmien, virtsateiden ja peräsuolen klamydiainfektioiden hoitoon. Toisinaan tetrasykliiniä määrätään potilaille, jotka eivät pysty ottamaan penisilliiniä vakavan infektion hoitoon. Henkilö, jolla on kuppa tai tippuri, voi myös määrätä tetrasykliiniä vaihtoehtoiseksi antibiootiksi penisilliinille.
Lääkitystä käytetään myös paikallisena sovelluksena vaikean aknen hoitoon. Sitä levitetään kasvoille, kunnes iho on kylläinen ja märkä. Paikallinen antibiootti voi poistaa aknen joillekin ihmisille, jotka eivät ole vastanneet muihin hoitomuotoihin.
Tetrasykliinihydrokloridin sivuvaikutukset ovat erilaisia. Useimmat ihmiset ilmoittavat pahoinvoinnista ja oksentelusta, kun he aloittavat lääkityksen. Ruokahaluttomuus ja vatsakipu ovat myös yleisesti havaittuja. Ripuli ja löysät, suuret suolenliikkeet ovat usein lääkkeen sivuvaikutus. Harvoin potilas ilmoittaa karvaisen mustan kielen kehittymisestä.
Muita yleisesti tetrasykliiniin liittyviä sivuvaikutuksia ovat jatkuva päänsärky ja huimaus. Jotkut ihmiset kokevat valoherkkyyttä tai ihottumaa. Lääkkeen ajankohtaisen muodon tiedetään aiheuttavan pistelyä levitettäessä, ja se on aiheuttanut joidenkin ihmisten ihon muuttuvan kellertäväksi. Tetrasykliinihydrokloridi voi myös aiheuttaa pysyvää hampaiden värjäytymistä alle kahdeksan vuoden ikäisillä lapsilla, jotka ovat ottaneet lääkettä. Aikuiset voivat huomata hammaskiilteen eroosion myös antibiootin ottamisen jälkeen.
Lääkkeen tiedetään kulkevan istukan läpi sikiölle raskauden aikana ja se erittyy rintamaitoon. Sellaisena tetrasykliinihydrokloridia ei suositella raskaana olevien tai imettäville äideille tarkoitettujen infektioiden hoitoon. Lapsilla, jotka ovat syntyneet äideille, jotka ovat ottaneet lääkkeen raskauden aikana, on raportoitu olevan harmahtavia hampaita ikääntyessään.