Kuten monet muutkin eläintyypit, myös käärmeet voivat joutua uhanalaiseksi. Tämä asema ei ole vain mahdollisuus. Monille näistä selkärangattomista matelijoista on tullut totta. San Franciscon sukkanauhakäärme, Kyproksen ruohonkäärme ja aavikon sarvinen kyy ovat esimerkkejä uhanalaisista käärmeistä. Mielenkiintoinen asia uhanalaisessa tilassa on kuitenkin se, että se ei ole aina johdonmukainen. Yksi hallitus tai järjestö voi tunnistaa eläimen uhanalaiseksi, kun taas toinen ei.
Monet pitävät San Franciscon sukkanauhaa perheensä kauneimpana käärmeenä. Tässä käärmeessä on sarja värillisiä raitoja. Pää näyttää yleensä punaiselta tai punertavan oranssilta. Siinä on myös vihreä selkäraita, jossa on musta reunus. Tätä rajaa reunustaa sitten punainen raita. Sen olemassaolon uskotaan rajoittuvan ensisijaisesti Kalifornian San Mateon piirikuntaan.
Kuten nimestä voi päätellä, aavikkosarvinen kyyli suosii kivistä aavikkoa. Näillä uhanalaisilla käärmeillä on yksi sarvi jokaisen silmän yläpuolella. Heidän ruumiinsa ovat yleensä ruskeanruskeat, jotka muistuttavat Pohjois -Afrikan tai Israelin autiomaasta löytyneitä kiviä, joista käärme löytyy. Siinä on myös tummempia ruskeita pilkkuja, jotka ovat levinneet vartaloonsa. Nämä värit toimivat naamiointimekanismina käärmeille, joilla on taipumus kaatua saaliinsa saamiseksi. Vaikka he ovat metsästäjiä ja myrkyllisiä käärmeitä, ihmisten suhteen niitä ei pidetä aggressiivisina.
Australian leveäpääinen käärme on yksi, jonka uhanalainen tila vaihtelee. Kansallisella ja kansainvälisellä tasolla käärmeen olemassaoloa pidetään haavoittuvana. Uudessa Etelä -Walesissa niitä pidetään kuitenkin uhanalaisina käärmeinä. Tämän käärmeen olemassaolon uskotaan rajoittuvan alueelle, joka tunnetaan Sydneyn altaana. Nämä matelijat ovat mustia ja keltaiset asteikot muodostavat monimutkaisia kuvioita. Kun nämä käärmeet tuntevat itsensä uhatuiksi, niiden päät laajenevat.
Connecticutissa puinen helistin on vaarassa. Se on yksi kahdesta osavaltiossa löydetystä myrkyllisestä käärmeestä. Vaikka näillä käärmeillä on yleensä pitkä elämä, ne lisääntyvät hitaasti ja pieninä määrinä. Näistä matelijoista on kaksi värivaihtoehtoa Connecticutissa. Tummalla lajilla on mustia ja tummanruskeita kuvioita, joiden välissä on pieniä keltaisia alueita. Vaaleammalla lajilla näyttää olevan keltainen tai ruskea tausta, joka on koristeltu mustilla tai ruskeilla renkailla.
Joskus uskottiin, että Kyproksen ruohonkäärme, jota kutsutaan myös Kyproksen vesikäärmeeksi, oli kuollut sukupuuttoon, mutta pieni populaatio löydettiin vuonna 1992. Väestö on niin pieni, että matelija on edelleen uhanalaisten käärmeiden luettelossa. Nämä myrkyttömät käärmeet, joiden väri voi vaihdella, viettävät paljon aikaa vedessä ja leikkivät usein kuolleina, kun he tuntevat itsensä uhatuiksi.