Kaksi yleisimpiä syitä vasektomian epäonnistumiseen eivät ole muiden syntyvyyden hallintamenetelmien käyttö ensimmäisten viikkojen tai kuukausien aikana toimenpiteen jälkeen ja vas deferensin spontaanista rekanalisaatiosta. Yleensä vasektomia on erittäin turvallinen ja luotettava ehkäisymenetelmä. Vaikka vasektomia voidaan joskus kääntää, vasektomia on pysyvä toimenpide, mikä tekee siitä yksinkertaisemman ja luotettavamman vaihtoehdon muille miesten ja naisten ehkäisymenetelmille.
Vasektomia on kirurginen toimenpide, joka katkaisee ja sulkee pienet putket, joita kutsutaan vas deferensiksi. Verisuonet vievät siittiöitä tuotantopaikastaan kiveksissä siemennesteeseen. Kun vas deferens leikataan, siittiöt eivät enää pääse siemennesteeseen niin, että vaikka mies pystyy edelleen siemensyöksymään normaalisti, hänen siemennesteensä ei enää voi kyllästää seksikumppaniaan. Toimenpide kestää viidestä 20 minuuttiin riippuen siitä, valitseeko potilas leikkaamattoman tai viiltävän vasektomian. Molemmissa menetelmissä on etuja ja haittoja, mutta molemmilla on erittäin pieni vaasektomian epäonnistumisen riski.
Vaikka vasektomiat ovat erittäin tehokkaita, kestää jonkin aikaa, ennen kuin kaikki siemennesteen siittiöt käytetään loppuun. Miehet saattavat joutua odottamaan viikkoja tai kuukausia toimenpiteen jälkeen voidakseen luottaa vasektomiaan ainoana syntyvyyden hallintamenetelmänään. Siemennesteanalyysi voi kertoa potilaalle, kun kaikki siemenneste ei enää sisällä siittiöitä. Yleisin syy vasektomian epäonnistumiseen on odottamatta, kunnes kaikki siittiöt on puhdistettu siemennesteestä.
Vaikka se on harvinaista, vas deferens voi muodostaa uudelleen yhteyden tai joutua spontaaniin rekanalisaatioon ja johtaa vasektomian epäonnistumiseen noin joka tuhannesta tapauksesta. Tämä tapahtuu yleensä ensimmäisten kuukausien aikana toimenpiteen jälkeen, joten uros tietää usein ennen kuin hän saa seksiä ilman muuta ehkäisymenetelmää, että vasektomia on epäonnistunut. Rekanalisointi voi tapahtua siittiöiden granulooman tai arpikudoksen muodostumisen vuoksi.
Siittiöiden granulooma muodostuu, kun siittiö vuotaa ulos vasektomiakohdasta ja aiheuttaa tulehdusreaktion. Yleensä tämä ei ole ongelma, mutta joissakin tapauksissa granulooma kehittyy massaksi, jota kutsutaan vasitis nosodumiksi, joka harvinaisissa tapauksissa voi muodostaa linkin leikattujen putkien kahden pään välille. Harvinaisissa tapauksissa arpikudos voi liittyä myös putkien päihin. Arpikudokseen voi muodostua pieniä kanavia, jolloin pieni määrä siittiöitä pääsee siemennesteeseen. Vaikka hedelmällisyys on paljon heikentynyt, nämä komplikaatiot voivat johtaa vasektomian epäonnistumiseen.
Rekanalisoinnin aiheuttama vasektomian epäonnistuminen liittyy usein kirurgin huonoon työhön. Eri menetelmät verisuonten päiden tiivistämiseksi voivat myös pienentää vasektomian tehokkuutta. Vaikka sen uskotaan olevan vähemmän mukavaa kuin vain tiivistetyn putken toisen pään tiivistäminen, voi olla tehokkaampaa sulkea leikatun vas deferensin molemmat päät. Putkien kauteroinnin uskotaan myös olevan luotettavampaa kuin sitominen tai puristaminen.