Lasten nivelkipu voi johtua vammasta, infektiosta tai sairaudesta. Yleisimmät nivelvammat ovat seurausta nivelen toistuvasta käytöstä tai nivelen hyperekstensiosta. Sairauksia, jotka voivat aiheuttaa nivelkipuja lapsilla, ovat nuorten nivelreuma, keliakia ja osteokondriitti. Reumaattinen kuume, Lymen tauti ja osteomyeliitti ovat infektioita, jotka voivat myös aiheuttaa nivelkipuja.
Lyhytaikainen tai nopea alkava nivelkipu lapsilla johtuu yleensä vammasta eikä sairaudesta. Toistuva liike, jota usein vaaditaan urheilun aikana, tai joustavan, nuoren nivelen hyperekstensio ovat yleisiä traumamuotoja, jotka johtavat nivelkipuihin. Jos kipu vähenee tai katoaa käyttämättömyyden jälkeen, vamma oli todennäköisesti kivun syy.
Kun nivelkipu on krooninen eikä lakkaa levossa, lasten nivelkivun syy voi olla infektio. Suurin todennäköinen infektio on reumaattinen kuume. Reumaattinen kuume esiintyy toisinaan noin 20 päivää kurkkukipu- tai tulirokkotulehduksen jälkeen, ja siihen liittyy nivelkipua ja turvotusta sekä kuumetta, hengenahdistusta ja rinta- ja vatsakipuja.
Tartunnan saaneet hirven punkit voivat siirtää Lymen taudin, joka voi lopulta aiheuttaa nivelkipua. Lymen tauti voi aluksi aiheuttaa vain pienen ihottuman, jolle on tunnusomaista vaaleanpunainen alue, jota ympäröi tummempi punainen. Useita päiviä tai viikkoja pureman jälkeen kehittyy nivelkipuja, jäykkyyttä ja yleisiä flunssan kaltaisia oireita.
Osteomyeliitti on luu -infektio. On harvinaisempaa kuin aiemmin mainitut infektiot, mutta se voi myös aiheuttaa lapsuuden nivelkipuja. Luuinfektio voi johtua, kun veri -infektio kulkee luuhun, tartunnan saanut pistoshaava leviää luuhun tai bakteerit tulevat luuhun yhdistelmämurtuman kautta.
Kun lapsuuden nivelkipuun liittyvä epämukavuus ei vähene passiivisuudesta tai tulee usein ja menee ajan myötä, se on usein seurausta sairaudesta. Todennäköisin sairaus on nivelreuma. Lasten nivelreumalle on tyypillisesti ominaista nivelkipu ja jäykkyys, jotka estävät lapsen liikkumista.
Lasten nivelkipu voi joskus johtua keliakiasta. Keliakia on autoimmuunisairaus, jossa gluteenin syöminen laukaisee immuunivasteen ruoansulatusjärjestelmää vastaan. Tauti vahingoittaa lopulta suoliston kykyä imeä ruokaa oikein. Nivelkipu on siihen liittyvä oire, ja nivelkipu voi olla seurausta tulehduksesta, joka johtuu kehon immuunivasteesta.
Osteokondriitti, ortopedinen sairaus, jolle on ominaista nopea luun kasvu, on toinen sairaus, joka aiheuttaa nivelkipuja lapsilla. Tuloksena nopeutuneesta luun kasvusta on häiriö veren saannissa rustoon aiheuttaen luukuoleman ja sitten uudelleenkasvun. Tämän luukuoleman ja uudelleenkasvun syklin uskotaan olevan syy siihen liittyvään nivelkipuun.