Yleensä kaikki tavalliset antibiootit on ryhmitelty luokkiin sen mukaan, miten ne tuhoavat bakteereja ja mitä erityisiä bakteerikantoja ja infektioita ne voivat hoitaa. Kaksi eniten määrättyjä antibiootteja ovat penisilliini ja kefalosporiinit. Nämä kaksi antibioottiryhmää toimivat samalla tavalla tuhoamalla bakteerien soluseinät ja tekemällä niistä haavoittuvia. Muita antibioottiluokkia ovat makrolidi ja aminoglykosidit. Nämä kaksi luokkaa toimivat sitomalla itsensä bakteereihin ja estämällä niiden proteiinituotantoa estäen siten niiden lisääntymisen.
Penisilliini on luultavasti yleisin antibiootti ja myös yksi vanhimmista, jonka Alexander Fleming löysi 1920 -luvun lopulla. Lajikkeistaan penisilliini V on tehokkain suun kautta otettuna, ja sitä voidaan juoda bakteeri -infektioihin, kuten nielurisatulehdukseen, ientulehdukseen ja jopa lievään pernaruttoon. Penisilliini G puolestaan on tyyppi, joka tuodaan suonien kautta ja jota voidaan käyttää kuppa, tippuri ja keuhkokuume. Muita suosittuja penisilliinilajikkeita ovat amoksisilliini ja ampisilliini, joilla molemmilla on laajempi spektri, joten niitä käytetään penisilliinien V ja G immuunien bakteerikantojen hoitoon.
Toinen yleinen antibioottiryhmä on kefalosporiinit. Tämä lääkitys toimii samalla tavalla kuin penisilliini, mutta bakteereilla on vähemmän taipumusta olla resistenttejä kefalosporiineille. Nämä antibiootit on ryhmitelty neljään “sukupolveen”, joista kukin seuraa, ja saavat laajemman kirjon eri bakteerikantoja vastaan. Kefalosporiinit voivat hoitaa kurkun infektioita, kuten nielurisatulehdusta ja nielutulehdusta, keuhkoinfektioita, kuten keuhkoputkentulehdusta, ja erilaisia ihoinfektioita. Niitä voidaan myös käyttää luun infektioiden torjumiseen.
Tetrasykliiniryhmän antibiootteja käytetään myös usein infektioiden hoitoon, mutta ne voivat olla vähemmän tehokkaita, koska bakteerit ovat yleensä vastustuskykyisempiä. Aivan kuten muutkin antibiootit, se voi hoitaa hengitystieinfektioita kurkussa, keuhkoissa sekä suoliston ja virtsatietulehduksissa (UTI). Tetrasykliinit ovat myös yleisiä antibiootteja ihosairauksiin, kuten ruusufinni ja akne, ja niitä voidaan yleensä saada ajankohtaisina voiteina ihotautilääkärin määräyksestä. Tetrasykliinilajikkeita ovat minosykliini, doksisykliini ja tetrasykliini.
Toinen aknen hoitoon käytetty antibioottien ryhmä on makrolidiantibiootit. Makrolidin yleisin variantti on erytromysiini, jota voidaan myös käyttää paikallisesti aknen peittämillä alueilla. Muita vaihtoehtoja ovat klarityomysiini ja atsitromysiini, joka on erityisen tehokas hengitystieinfektioissa. Näitä yleisiä antibiootteja tulee käyttää erityisen varovaisesti maksan toksisuuden välttämiseksi.
Useiden vakavien bakteeri -infektioiden tapauksessa aminoglykosidiryhmä antibiootteja voi olla erittäin tehokas ja se annetaan yleensä laskimonsisäisesti. Aminoglykosidit toimivat myös kuten makrolidit, estäen bakteereja muodostamasta enemmän proteiineja. Nämä yleiset antibiootit voidaan myös yhdistää muiden antibioottien, kuten penisilliinin, kanssa tehokkaampaan hoitoon. Bakteerien vastustuskyky on yksi ryhmän haitoista, joten lääkityksen asianmukainen saanti on avainasemassa. Yksi yleisimmistä aminoglykosidityypeistä on streptomysiini, jota voidaan käyttää tuberkuloosia vastaan.