On olemassa useita sairauksia, jotka voivat vaikuttaa papukaijaan, ja jotkut niistä voivat siirtyä ihmisille. Jotkut yleisimmistä papukaijataudeista ovat polyooma, psittacine -nokka- ja höyhentauti sekä klamydia psittaci. Muita papukaijatauteja ovat proventrikulaarinen dilataatiotauti ja aspergillus. Lintueläinlääkäriä on kuultava aina, kun lemmikkipapukaija näyttää sairaalta, jotta voidaan saada tarkka diagnoosi ja yksilöllinen hoitosuunnitelma.
Polyoma on yksi yleisimmin tarttuvista lintujen sairauksista. Tätä virustautia ei voida siirtää ihmisiin, ja se on erityisen haitallista papukaijavauvoille. Tämän taudin oireita voivat olla ripuli, regurgitaatio tai vatsan turvotus, vaikka jotkut papukaijat kuolevat tästä sairaudesta ilman fyysisiä sairauden oireita. Monilla maailman alueilla on saatavilla rokote, joka on suunniteltu estämään tämän mahdollisesti kuolemaan johtavan sairauden esiintyminen.
Psittacine -nokka- ja höyhentauti on parantumaton sairaus, joka aiheuttaa höyhenen menetyksen, epänormaalin muotoisen nokan ja laihtumisen. Tätä tautia ei voida välittää ihmisille, vaikka sitä pidetään tarttuvana muiden lintujen osalta. Tähän sairauteen ei ole saatavilla hoitoa, joten kaikki muut linnut alueella on eristettävä tartunnan saaneesta linnusta.
Chlamydia psittaci kuuluu papukaijatauteihin, jotka voivat tarttua ihmisiin. Jotkut linnut voivat olla tämän taudin kantajia, mutta niillä ei ole sairauden oireita. Chlamydia psittaci -linnulla voi olla merkkejä ylähengitystieinfektiosta. Ihmiset, jotka ovat alttiimpia sairastumaan tähän sairauteen, ovat pieniä lapsia, vanhuksia tai heikentyneitä immuunijärjestelmiä.
Proventrikulaarinen dilataatiotauti on yksi yleisimmistä papukaijataudeista, ja sen aiheuttaa virusinfektio. Tämä sairaus on tarttuva lintujen keskuudessa, mutta se ei tartu ihmisiin. Oireita voivat olla regurgitaatio, nopea laihtuminen ja kouristukset. Saatavilla olevat hoitovaihtoehdot voivat pidentää linnun ikää, mutta proventrikulaariseen dilataatiotautiin ei ole parannuskeinoa.
Aspergillus on toinen yleisimmistä papukaijataudeista ja sen aiheuttaa sieni. Tätä ehtoa pidetään tarttuvana, mutta sitä esiintyy useimmiten lintujen keskuudessa, joita pidetään epähygieenisissä olosuhteissa. Ihmiset voivat myös saada tämän taudin, vaikka se tarttuu harvoin linnuista ihmisiin. Papukaijat, joilla on aspergillus, hoidetaan yleensä lääkkeillä, vaikka pätevän lintueläinlääkärin leikkaus voi joissakin tapauksissa olla tarpeen.