On viisi tärkeintä siittiöongelmaa, jotka voivat vaikuttaa miesten hedelmällisyyteen. Näitä ovat oligospermia, atsoospermia, klinefelterin oireyhtymä, aspermia ja epänormaali morfologia. Jokainen ongelma voi johtua eri olosuhteista ja vaatii erilaista hoitoa.
Normaalin siittiöiden määrän odotetaan olevan noin 20 millilitraa (20 kuutiosenttimetriä). Kun siittiöiden määrä on tätä määrää pienempi, sitä kutsutaan oligospermiaksi tai alhaiseksi siittiöiden lukumääräksi. Tämä on yksi monista siittiöiden ongelmista, jotka voivat estää miesten hedelmällisyyttä. Kun siittiöiden määrä on alhainen, miehet eivät ehkä pysty helposti kyllästämään naista ilman mieshormonien tai keinosiemennyksen apua.
Oligospermia, joka johtaa myös alhaiseen siittiöiden määrään, johtuu tyypillisesti ympäristön saastumisesta, altistumisesta röntgensäteilylle tai korkeista lämpötiloista kivespussin ympärillä. Se voi johtua myös alkoholin tai virkistyslääkkeiden toistuvasta käytöstä. Infektiot voivat myös vaikuttaa osittain tämän tyyppisiin siittiöongelmiin.
Azoospermia on toinen siittiöiden ongelma, jonka miehet voivat kohdata; se tapahtuu, kun siemennesteessä ei ole lainkaan siittiöitä. Vaikka tämä on harvinaista, se voi olla vakavaa ja johtaa hedelmättömyyden puutteeseen. Tämäntyyppinen siittiöiden ongelma on jaettu kahteen luokkaan: estetty ja estetty. Jos siittiö on tukossa, se voi johtua infektiosta, aiemmasta leikkauksesta tai kystista. Se voi johtua myös synnynnäisestä viasta, jossa vas deferens – kanavat, joita keho käyttää siittiöiden lähettämiseen virtsaputkeen – eivät ole kehossa.
Estettyjen siittiöiden hoito vaatii yleensä leikkausta tai siittiöiden hakua. Jos siittiöongelmat eivät johdu tukkeutumisesta, voidaan käyttää siittiöiden noutoa ja avustettua lisääntymistä, mutta vain noin puolessa tällaista hoitoa saavista miehistä on käyttökelpoisia siittiöitä. Geneettisiä vikoja, jotka ovat vastuussa monista atsoospermian tapauksista, on yleensä mahdotonta hoitaa.
Klinefelterin oireyhtymä johtaa yleensä myös siittiöiden täydelliseen puuttumiseen. Joissakin tapauksissa tämä geneettinen vika voi kuitenkin sisältää pienen määrän siittiöitä, mutta ei tarpeeksi hedelmälliseksi. Tämä oireyhtymä johtuu ylimääräisestä X -kromosomista. Vaikka useimmilla miehillä on kromosomit XY, miehellä, jolla on tällainen siittiöongelma, on kromosomit XXY.
Toinen yleisimmistä siittiöongelmista on aspermia, mikä tarkoittaa, että mies ei tuota siemennestettä. Tämä voi johtua niin kutsutusta taaksepäin suuntautuvasta siemensyöksystä tai ejakulaatiokanavan tukkeutumisesta. Retrogradinen siemensyöksy tapahtuu, kun miehen siemenneste ohjataan ulos virtsarakon kautta virtsaputken sijaan. Siemensyöksykanavan tukos johtuu tukkeutumisesta – kuten kysta tai tulehdus infektiosta – tai lisääntymisjärjestelmän ympärillä olevasta ongelmasta. Tiettyjä lääkkeitä voidaan käyttää näiden sairauksien hoitoon, ja myös kirurgisia hoitoja voidaan kokeilla.
Kun siittiöillä on epänormaali morfologia, niitä ei muotoilla niin kuin niiden pitäisi olla, mikä johtaa niiden liikkumiseen eri tavalla kuin normaalit siittiöt. Kun tällaisia poikkeavuuksia ilmenee, ne voivat aiheuttaa hedelmällisyyteen liittyviä siittiöiden ongelmia, koska siittiöt eivät pysty uimaan onnistuneesti naisen kohdunkaulan liman läpi. Tämä vaikeuttaa siittiöiden pääsyä munasoluun ja tunkeutua siihen hedelmöittymistä varten.