Virukset ja bakteerit johtavat luetteloa tekijöistä, jotka yleensä aiheuttavat kurkkukipua ja pahoinvointia. Ympäristöallergeenit, sairaudet ja lääkkeet voivat myös saada ihmisen pahoinvoimaan ja aiheuttaa hänelle kurkkukipua joko yhdessä tai erikseen. Syöpähoitoa saavat potilaat valittavat usein, että kemoterapia voi aiheuttaa kurkkukipua ja pahoinvointia, kun taas syövän säteily aiheuttaa yleensä pahoinvointia. Nämä oireet kestävät yleensä 24 tunnista kolmeen päivään.
Kurkkukipu voi ilmaantua flunssaviruksen hyökkäyksen jälkeen raakana, kipeänä tunteena kurkun limakalvossa, mikä on huomattavinta nielemisen aikana. Vakavat tapaukset voivat vaikeuttaa nielemistä, ja niitä esiintyy usein liman kanssa. Vilustumisen lisäksi lantio, flunssa ja mononukleoosi ovat muita erityisiä viruksia, jotka useimmiten aiheuttavat kurkkukipuja. Virukset, jotka aiheuttavat vesirokkoa ja tuhkarokkoa, voivat myös tuottaa raakoja ja kipeitä kurkkuja.
10–50 prosentissa bakteeripohjaisista kurkkukipu- ja pahoinvointitapauksista näyttää olevan syyllinen streptokokkibakteeri, jota seuraa ihottumaa aiheuttava arcanobacterium haemolyticum -bakteeri. Muita erityisiä bakteerisyitä ovat tonsilliitti ja kurkkumätä. Nämä ilmassa leviävät bakteerit yhdessä aiemmin tunnistettujen ilmassa olevien virusten kanssa leviävät helposti sairaalta henkilöltä toiselle tunkeutumalla ympäröivään ilmaan kärsivän henkilön aivastusten ja yskäkouristusten seurauksena. Sitten tartunnat hengitetään hengityselimiin. Kosketus limakalvoihin ja bakteereihin jaetuissa pyyhkeissä, ovenkahvoissa ja ruokailuvälineissä voi myös siirtää kurkkukipua aiheuttavia mikrobeja.
Pahoinvointiin, joka on sairaus, jossa vatsa on epävakaa ja joka yrittää poistaa sen sisällön, keuhkokuume ja keuhkoputkentulehdus ovat johtavia bakteeri- ja virusperäisiä syitä. Usein E. colin bakteerien, salmonellan ja listerian aiheuttama gastriitti ruoassa tai vedessä on pahoinvoinnin syyllinen. Mahalaukun tulehdus, jota kutsutaan virallisesti gastriitiksi, voi esiintyä myös mahasta.
Sairaudet, kuten haima, hepatiitti ja syöpä, aiheuttavat usein pahoinvointia. Usein mahalaukkua vuoraavia syöpäkasvaimia ei havaita, ennen kuin pahoinvoiva potilas alkaa oksentamaan säännöllisesti ja menee sitten lääkäriin selityksen ja diagnoosin saamiseksi. Maalliset aiheuttajat, kuten huono haju, epämiellyttävä ruoka ja huoli, voivat myös johtaa pahoinvointiin; samoin voi aamupahoinvointi ja raskaus.
Kun kurkkukipu ja pahoinvointi kestävät yli 72 tuntia, uhrit valitsevat yleensä lääkärin. Pahoinvointia ehkäiseviä reseptilääkkeitä, kuten prometatsiinia tai droperidolia, määrätään usein. Kurkkukipun tapauksessa lääkärit suorittavat tavallisesti streptokokeita ja määräävät antibiootteja tai penisilliiniä.