Yleisimpiä syitä siittiöiden tuotantoon miehillä ovat geneettiset viat, jotka vaikuttavat heidän hedelmällisyyteensä. Joskus nämä viat voivat vaikuttaa siittiöiden tuotantoon, ja toisinaan ne voivat aiheuttaa tukoksen, joka estää siittiöiden vapautumisen. Muita mahdollisia syitä siittiöiden vähäiseen määrään tai ei ollenkaan voi olla kiveksen tai peniksen vamma ja vasektomia.
Klinefelterin oireyhtymä on yleisin syy siittiöiden tuotantoon. Se on geneettinen mutaatio, jossa miehellä on ylimääräinen sukupuolikromosomi. Useimmilla miehillä on yksi X -kromosomi ja yksi Y. Klinefelterin oireyhtymästä kärsivillä on ylimääräinen X -kromosomi, mikä johtaa liialliseen rintojen tuotantoon, pieniin koviin kiveksiin ja hedelmättömyyteen. On myös geneettisiä vikoja, jotka voivat muuttaa miesten hormonaalista tasapainoa, ja ne voivat myös johtaa siittiöiden puutteeseen. Miehet, joilla on ongelmia isän kanssa kumppaninsa kanssa, on testattava näiden poikkeavuuksien varalta.
Toinen geneettinen tila, joka voi johtaa siittiöiden puuttumiseen, on van deferensin (CAVD) synnynnäinen puuttuminen. Tämä johtaa kanavien puutteeseen, joita tarvitaan sperman erittymiseen siemennesteeseen. Joskus uroksella voi olla kanavia, mutta ne ovat epämuodostuneita. Miehillä, joilla on tämä tila, on tyypillisesti keskimääräinen siittiöiden tuotanto, mutta siittiösolut ovat loukussa kiveksissä ilman tapaa paeta. Miehet, joilla on CAVD, voivat silti kyllästää naisen keinosiemennyksellä, tai joissakin tapauksissa voidaan tehdä leikkaus tukosten poistamiseksi.
Joissakin tapauksissa miehellä voi olla siittiöiden puuttuminen tuntemattomista syistä. Muina aikoina peniksen tai kiveksen loukkaantuminen voi johtaa siittiöiden tuotantoon. Näissä tapauksissa joillakin miehillä voi olla korjaavia toimenpiteitä vaurioiden korjaamiseksi. Monta kertaa tätä ei kuitenkaan voida tehdä, ja tuloksena on pysyvä hedelmättömyys.
Miehillä, joille on tehty vasektomia, siittiöiden määrä on myös nolla. Siittiöitä tuotetaan edelleen kiveksissä, mutta niiden ja peniksen välinen kanava on tukossa tai katkaistu. Joissakin tapauksissa vasektomia voidaan peruuttaa ja täydellinen tai osittainen hedelmällisyys voidaan palauttaa, mutta tämä ei ole aina vaihtoehto.
Jopa miehillä, joilla on nolla siittiöitä, voi olla pieni määrä siittiöitä kiveksissä. Nykyaikaiset hedelmättömyyshoidot voivat joskus mahdollistaa näiden siittiöiden noutamisen ja käytön. Ne, joilla ei todellakaan ole siittiöitä, joutuvat turvautumaan siittiöiden luovuttajaan saadakseen perheen kumppaniensa kanssa.