Biokemistin ansaitsemassa palkassa voi olla useita tekijöitä. Biokemisti voi hallita joitakin näistä tekijöistä, kun taas toiset voivat olla enemmän alakohtaisia vaikutuksia, joita biokemisti ei voi hallita. Biokemistin palkka -alue voi vaihdella laajasti, ja on tärkeää ottaa huomioon palkkaan vaikuttavat vaikutukset arvioitaessa työtarjousta sen määrittämiseksi, onko palkka kohtuullinen.
Yksi suurimmista biokemistin palkkaa määräävistä tekijöistä on se, missä biokemisti työskentelee. Eri valtioilla on radikaalisti erilaiset palkka -asteikot ja elinkustannukset. Esimerkiksi Britanniassa työskentelevä biokemisti tekee todennäköisesti enemmän kuin Intiassa työskentelevä biokemisti pelkästään elinkustannusten vuoksi. Samoin kansainvälisessä yrityksessä työskentelevä biokemisti voi ansaita useamman kuin yhden kotimaisen yrityksen palveluksessa. Myös sillä, minkä tyyppisellä yrityksellä biokemisti työskentelee, on merkitystä. Lääkeyritykset maksavat yleensä erittäin korkeita palkkoja, kun taas valtion virastoilla on vähemmän rahaa palkkoihin.
Toinen tekijä biokemistin palkassa on biokemistin saaman koulutuksen määrä. Mitä korkeampi korkeakoulututkinto, sitä korkeampi palkka yleensä. Lisää kokemusta työskentelevästä biokemististä voi myös nostaa biokemistin palkkaa, samoin kuin erityisiä sertifikaatteja ja koulutusta. Esimerkiksi biokemikkoa, joka on työskennellyt korkealla tasolla ja erittäin turvallisessa laboratoriossa, pidetään houkuttelevampana työehdokkaana kuin biokemikkoa, joka ei ole, joten kokeneempi biokemisti voi vaatia ja saada korkeampaa palkkaa.
Yrityksen koolla voi olla merkitystä myös biokemistin palkan suhteen, samoin kuin yrityksen luonteella. Voittoa tavoittelemattomat järjestöt maksavat vähemmän, kun taas voittoa tavoittelemattomat järjestöt maksavat enemmän. Osittain tämä johtuu käytettävissä olevasta rahoituksesta ja osittain organisaation luonteesta. Työn tyypillä on myös merkitystä. Edistynyt tutkimus johtaa korkeampaan biokemistin palkkaan, kun taas laboratoriomateriaalien rutiinikäsittely maksaa vähemmän. Tutkimuslehdissä julkaistu historia nostaa myös biokemistin palkkaa, samoin kuin osallistuminen konferensseihin ja muuhun ammatilliseen kehittymiseen.
Työnimikkeilläkin on väliä. Mitä edistyneempi virka, sitä korkeampi palkka, vaikka kaksi eri nimikkeellä olevaa henkilöä tekisivät paljon samaa työtä. Tämä on yksi syy siihen, miksi ihmiset ovat hyvin varovaisia neuvotellessaan tehtävistä kiinnittäen huomiota muihin yrityksessä ja laboratoriossa käytettyihin nimikkeisiin. Myös sopimusvelvoitteilla voi olla merkitystä. Jos biokemisti allekirjoittaa sopimukset, jotka osoittavat, että hän viettää pitkään yrityksen kanssa eikä työskentele kilpailevien yritysten palveluksessa, yritys maksaa enemmän, tunnustamalla työntekijän korkean sitoutumisen.