Elinajanodote munuaissairauden kanssa voi riippua taudin diagnoosin vaiheesta, potilaan yleisestä terveydentilasta ja iästä sekä siitä, millaista hoitoa potilas saa. Potilaiden, joilla on munuaissairausdiagnoosi, tulee pyytää lääkäriltä täydellistä yleiskatsausta, jotta he ymmärtävät vaihtoehtonsa ja erilaiset ennusteet. On myös tärkeää punnita elämänlaatukysymyksiä, koska potilas saattaa elää neljä vuotta yhdellä hoidolla ja kaksi toisella, mutta hänellä voi olla parempi elämänlaatu lyhyemmällä ennusteella.
Lääketieteen ammattilaiset asettavat munuaissairauden yhden, vähiten vakavan muodon ja viiden vakavimman välillä. Ne erottavat myös akuutin ja kroonisen sairauden. Akuutissa sairaudessa munuaiset ylikuormittuvat nopeasti infektion tai toksiinille altistumisen takia. Krooninen sairaus kehittyy ajan myötä ja edustaa elinten hidasta toimintahäiriötä. Akuutissa tilassa ennuste voi itse asiassa olla varsin hyvä, jos potilas saa tukihoitoa. Dialyysi saattaa olla tarpeen munuaisten hoitamiseksi aluksi, ja potilas voi toipua täysin. Krooniseen sairauteen liittyy pysyviä vaurioita, ja se voi olla vähemmän selviytyvä.
Mitä alempi munuaissairaus diagnoosihetkellä, sitä parempi. Potilas, jolla on toisen vaiheen sairaus, voi pystyä hallitsemaan sitä lääkkeillä, ruokavaliolla ja muilla toimenpiteillä, joilla munuaiset toimivat hyvin vanhuuteen. Viidennen vaiheen munuaissairauden elinajanodote on sen sijaan paljon lyhyempi. Potilailla, joilla on muita sairauksia, kuten diabetes tai sydänsairaus, on myös lyhyempi elinajanodote, koska heidän ruumiinsa ovat jo stressissä.
Hoidot voivat sisältää lääkkeitä, ruokavaliota, liikuntaa, dialyysiä ja munuaisensiirtoja. Elinajanodote munuaissairauden kanssa voi parantua kehittyneemmillä hoidoilla, mutta elämänlaadusta voi tulla ongelma. Vanhempi potilas saattaa esimerkiksi pitää dialyysiä kolme kertaa viikossa sietämättömänä ja saattaa haluta konservatiivisempaa hoitoa. Sitä vastoin suhteellisen terve nuori potilas saattaa olla halukas dialyysihoitoon ja pääsemään munuaisensiirron odotuslistalle.
Ikä on toinen keskeinen tekijä, ja yli 65 -vuotiaiden munuaissairaiden potilaiden elinajanodote on lyhentynyt. Myös mustilla potilailla on yleensä lyhyempi elinajanodote, samoin kuin alemmilla talousluokilla. Nämä potilaat eivät ehkä saa diagnoosia ennen kuin heillä on pitkälle edennyt sairaus, ja he voivat saada vähemmän hoitovaihtoehtoja. Lopulta potilaan elinajanodote riippuu siitä, kuinka hyvin potilas noudattaa hoitoa. Suurin osa potilaista kuolee munuaisvaivojen aiheuttamaan toissijaiseen sydän- ja verisuonisairauteen.